Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  240  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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C
G
T
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2.00
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1.50
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44
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2.2
23
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2
2
69
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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29
19
28
1.98
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46
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204
23
29
20
26
1.99
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2.8
94
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256
23
29
21
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1.99
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18
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1.83
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1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
74460443--74460481
20
2.0
20
90
10
62
33
0
20
46
1.51
74463281--74463486
113
1.9
110
85
6
290
23
21
17
37
1.94
74463406--74463947
116
4.7
114
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520
23
19
14
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11
2.3
11
100
0
50
0
8
16
76
1.02
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20
2.7
18
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1
9
20
1.28
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15
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0
12
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74467006--74467271
27
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27
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221
60
0
11
27
1.33
74466996--74467271
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76
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0
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49
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186
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0
10
26
1.30
74467178--74467335
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41
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14
136
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0
8
26
1.28
74467329--74467362
17
1.9
18
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58
0
23
17
1.38
74467777--74467838
28
2.2
28
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5
81
54
0
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30
1.40
74467790--74467838
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0
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1.38
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20
2.0
21
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7
2
9
80
0.97
74471756--74471826
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31
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0
40
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1.84
74472091--74472128
19
2.0
20
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28
10
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2.1
22
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10
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18
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18
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34
1.78
74481858--74482098
90
2.7
87
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1.56
74482606--74482671
27
2.4
27
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0
105
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1
18
1.57
74482832--74483073
46
5.2
48
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15
211
24
28
12
34
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
74482868--74483073
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4.4
46
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13
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23
28
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1.90
74482785--74483073
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3.1
93
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29
11
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1.92
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2.0
114
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1
376
35
19
20
24
1.95
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20
2.1
20
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1.20
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1.12
74493616--74493679
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1.12
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1.10
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0
0
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0
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2.0
21
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0
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1.06
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21
2.1
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0
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140
36
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112
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15
2.4
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20
0
34
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1.51
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3.2
14
83
0
63
31
0
20
48
1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
74527149--74527180
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2.1
15
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3
0
34
1.11
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2.2
41
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10
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1.58
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23
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1.79
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46
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1.79
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1038
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10
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23
2.2
22
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64
40
2
10
48
1.48

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410