Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  378  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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9
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1.64
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0
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1.83
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69
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2.0
21
90
0
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48
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2.4
24
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8
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1.38
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2.0
31
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92
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115097837--115097898
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2.0
30
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12
22
1.46
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1.50
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2.3
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58
4
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2.0
20
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2.0
44
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0
120
32
14
19
33
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
43
93
0
121
28
19
19
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1.96
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138
3.2
138
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481
29
19
18
32
1.95
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94
2.4
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2.1
22
88
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19
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0
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1.9
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201
2.0
202
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2.1
42
91
0
142
50
14
6
28
1.68
115150623--115150662
19
2.2
18
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71
42
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40
1.60
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2.4
28
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1
38
1.16
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3
38.0
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70
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58
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4
38
1.17
115156270--115156457
3
62.3
3
68
14
66
60
2
4
31
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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18
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6
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69
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2
60
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5.7
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59
1.33
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0
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1.9
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10
6
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1.58
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3
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13
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33
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0
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3
53
1.60
Indices
Period
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Copy
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Consensus
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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0
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24
19
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2.0
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1.98
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148
29
29
20
20
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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30
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
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0
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0
0
50
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410