Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  100  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.94
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Period
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Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
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119
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1.99
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27
19
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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1.96
Indices
Period
Size
Copy
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Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29539884--29540202
46
6.7
49
75
14
203
26
17
29
25
1.97
29539979--29540202
99
2.4
92
84
8
265
25
17
30
26
1.97
29540066--29540202
49
2.8
50
81
7
172
24
18
31
26
1.97
29541972--29542335
46
7.7
47
72
11
200
27
19
28
24
1.98
29541972--29542329
140
2.5
140
81
9
397
27
19
28
24
1.98
29544366--29544405
21
2.0
20
90
5
62
12
40
27
20
1.88
29545239--29545269
6
5.2
6
100
0
62
67
16
0
16
1.23
29562328--29562438
40
2.8
39
81
9
118
21
27
25
25
1.99
29576105--29576271
40
4.2
39
83
8
187
23
21
28
26
1.99
29576105--29576271
79
2.1
79
84
5
212
23
21
28
26
1.99
29588103--29588144
17
2.4
18
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8
50
33
23
2
40
1.68
29594681--29594741
30
2.1
30
90
3
97
34
22
16
26
1.95
29596611--29596717
42
2.5
42
96
0
196
28
14
33
22
1.94
29596725--29596794
27
2.5
28
86
2
97
27
14
25
32
1.94
29604019--29604125
42
2.5
42
96
0
196
28
14
33
22
1.94
29604133--29604201
27
2.5
28
78
4
77
28
15
21
33
1.95
29608590--29608772
40
4.6
40
85
5
212
26
26
20
26
1.99
29608557--29608772
80
2.7
80
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13
223
25
26
20
27
1.99
29614592--29614633
20
2.1
20
86
0
57
35
11
2
50
1.52
29620151--29620225
29
2.6
29
84
0
96
26
30
18
24
1.98
29625154--29625192
20
1.9
21
84
5
53
30
28
12
28
1.93
29627654--29627903
130
1.9
132
84
1
333
29
19
16
34
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29627797--29628105
130
2.4
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4
291
26
19
19
35
1.95
29638822--29638851
11
2.6
11
94
5
51
90
0
0
10
0.47
29639690--29640120
132
3.3
132
83
1
585
29
15
28
26
1.96
29639688--29640120
44
9.8
44
82
1
517
29
15
28
26
1.96
29640462--29640505
19
2.3
19
92
0
70
43
31
6
18
1.76
29642984--29643220
130
1.8
132
83
3
318
29
19
16
33
1.95
29646658--29646828
46
3.7
46
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166
26
19
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22
1.98
29646658--29646828
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1.8
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2
220
26
19
30
22
1.98
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24
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4.2
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25
21
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50
24
18
22
34
1.96
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4.2
40
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6
169
25
21
27
25
1.99
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2.0
27
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1
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1.30
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2.0
21
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0
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0
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0
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2.0
421
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3.9
44
75
10
171
28
17
29
25
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29697422--29697541
48
2.6
45
74
10
109
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15
30
26
1.96
29698516--29698585
28
2.5
28
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4
97
15
15
47
21
1.83
29701657--29701701
21
2.3
19
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1.70
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2.0
22
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11
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1.98
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1.98
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3.5
28
84
5
121
34
28
13
25
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410