Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  398  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
120634262--120634613
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7.7
46
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2
168
22
22
15
39
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120634353--120634701
46
7.6
46
95
0
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22
23
16
37
1.93
120636469--120636518
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4.4
11
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2
0
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2.9
21
70
0
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49
21
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1.79
120637516--120637583
21
3.2
20
69
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55
48
20
16
14
1.81
120637514--120637623
42
2.6
42
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0
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20
19
14
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19
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3.9
26
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0
168
36
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2.0
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0
0
50
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113
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3
28
1.38
120673084--120673151
27
2.6
25
80
13
73
63
7
1
27
1.30
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1.9
18
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0
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20
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4.8
47
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16
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1.96
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54
4.9
51
83
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220
31
28
15
24
1.95
120681925--120682086
54
3.0
54
90
1
247
32
27
14
24
1.95
120684455--120684737
134
2.1
136
93
3
491
31
22
19
26
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
120686512--120686620
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4.2
26
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1
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4
33
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120690380--120690664
135
2.1
137
95
1
520
31
24
19
25
1.98
120692438--120692521
26
3.2
26
91
6
143
38
23
3
34
1.72
120695558--120695701
54
2.8
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165
32
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15
25
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27
30
1.97
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2
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26
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26
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6
4
59
1.43
120704449--120704522
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3.4
23
76
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0
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1.00
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2.0
40
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22
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1.98
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62
66
2
4
27
1.21
120710974--120711003
15
2.0
15
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0
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40
10
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2
13
0
84
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120711576--120711613
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2.2
17
95
0
67
0
13
0
86
0.56
120711576--120711613
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4.5
8
93
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58
0
13
0
86
0.56
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6.0
14
75
20
82
78
0
1
20
0.81
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5
13.4
5
77
17
59
80
0
1
18
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62
62
2
10
25
1.38
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15
2.0
15
93
0
51
40
10
0
50
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
120721190--120721249
20
3.1
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25
50
38
6
20
35
1.79
120721172--120721249
40
2.0
40
92
0
129
33
6
23
37
1.80
120729075--120729131
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1.9
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85
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80
26
10
22
40
1.86
120732919--120733218
127
2.3
130
79
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333
35
21
18
25
1.95
120733246--120733482
130
1.8
130
87
3
352
35
17
18
28
1.94
120735789--120735841
26
2.0
27
85
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74
24
15
22
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1.92
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4.2
26
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193
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3.0
133
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672
28
27
17
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1.98
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5.3
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15
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1.96
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17
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0
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2.1
18
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56
72
0
0
27
0.85
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2.3
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62
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0
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1
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1
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2
0
66
1.03
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2.2
18
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4
71
20
22
5
52
1.65
Indices
Period
Size
Copy
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Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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G
T
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1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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2.1
151
79
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350
25
17
19
37
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
120795838--120795874
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8
61
30
1
1
65
1.14

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410