Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  208  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
63559005--63559061
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1
47
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2.9
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2
1
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1.22
63559529--63559603
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75
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2
1
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1.21
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2
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0
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1.00
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20
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21
29
20
28
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63567014--63567416
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2.9
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21
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20
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1.98
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2.9
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2.0
48
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0
0
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0
41
1.56
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21
2.7
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27
29
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1.66
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2.2
30
86
2
87
27
41
20
10
1.85
63586325--63586369
21
2.2
21
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11
1.82
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126
2.5
126
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1
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28
16
16
38
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
17
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0
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32
0
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18
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3
0
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1.15
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2.2
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220
42
3
4
49
1.42
63611105--63611142
11
3.5
11
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15
5
0
78
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13
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0
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2.0
21
90
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2.0
30
96
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2.0
286
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0
50
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1.94
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263
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19
26
26
1.99
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2.3
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151
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14
25
27
1.95
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53
2.6
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21
23
18
35
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2.0
24
84
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51
17
0
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1.46
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19
2.0
20
85
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55
0
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2.0
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2.0
42
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20
18
30
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158
25
17
31
26
1.97
63655505--63655682
49
3.7
47
79
8
180
25
16
31
26
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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409
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17
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2
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1.25
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2.0
19
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5
93
0
65
24
18
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20
1.93
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3.7
39
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2
234
26
20
30
22
1.99
63686299--63686480
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2.3
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2
269
24
22
29
23
1.99
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3.7
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0
234
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21
29
22
1.99
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2.3
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1
269
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22
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1.99
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0
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1.98
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2.8
13
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4
54
20
2
0
77
0.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
63715125--63715449
89
3.6
88
82
3
348
24
23
17
35
1.95
63718501--63718721
45
5.0
45
89
1
356
26
28
22
22
1.99
63718501--63718721
89
2.5
90
91
1
356
26
28
22
22
1.99
63727945--63728057
56
2.0
56
100
0
226
36
28
5
30
1.79
63732409--63732440
7
4.4
7
96
4
55
12
3
46
37
1.57
63734778--63734821
6
7.3
6
87
10
63
45
15
20
18
1.85
63735915--63735948
2
17.0
2
100
0
68
50
0
0
50
1.00
63750793--63750871
25
3.3
25
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16
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31
30
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32
1.79
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47
9.6
47
91
3
697
28
29
8
33
1.86
63750743--63751203
96
4.8
94
92
2
715
28
29
8
33
1.86
63758759--63758919
29
5.6
29
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1
207
26
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16
25
1.96
63761581--63761729
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
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40
2.7
38
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128
21
29
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1.99
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80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
63763439--63763546
40
2.7
38
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8
128
21
29
25
23
1.99
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22
2.0
22
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52
41
27
4
25
1.75
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43
4.6
42
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1
235
28
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1.96
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0
0
27
0.85
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40
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40
90
2
422
25
28
22
23
2.00
63778545--63778838
119
2.5
119
87
3
414
25
28
22
23
1.99
63778545--63778841
159
1.9
159
89
2
463
25
28
22
23
2.00
63784608--63784790
40
4.6
40
88
1
251
28
29
20
21
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
63790039--63790335
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7.5
40
93
2
467
24
28
23
23
2.00
63790039--63790335
119
2.5
119
91
3
465
24
28
23
23
2.00
63792702--63792734
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9
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0
57
0
12
0
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119
1.9
119
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0
353
28
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5
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0
1
22
0.87
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0
1
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0.89
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0
2
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0.94
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25
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0
1
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1.98
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0
0
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63800107--63800155
10
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10
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2
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22
1.28
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20
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1.97
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2.1
137
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0
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26
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23
2.1
23
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14
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32
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0
0
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3.5
20
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77
55
4
0
40
1.20
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2.0
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0
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0
40
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13
2.0
13
100
0
52
76
0
15
7
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
63815751--63815913
81
2.0
81
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2
292
31
19
3
46
1.67
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22
3.3
22
64
24
62
30
12
20
36
1.90
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43
2.0
43
100
0
174
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1.87
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23
2.3
23
90
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21
17
19
42
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5
130
23
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22
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0
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20
100
0
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5.2
40
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4
208
26
22
25
25
2.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410