Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  12  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3035823--3035860
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0
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0
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0
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2
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2.4
29
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2.3
23
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106
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1
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1
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15
2.1
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0
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18
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17
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210
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23
10
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1.89
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2.6
37
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12
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3
0
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1.17
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2.1
31
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6
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4
0
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1.23
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18
2.2
19
91
4
66
65
0
7
26
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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40
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2.1
25
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0
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29
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30
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0
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48
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13
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2.0
22
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2.0
21
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2.0
21
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4
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0
1
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2
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0
0
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38
0
1
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22
2.1
20
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8
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11
15
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1.81
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27
2.1
29
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0
0
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2.0
32
100
0
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6
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2.0
38
94
0
134
39
13
21
26
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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15
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0
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55
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0
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1.23
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0
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0
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1.00
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1
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18
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51
0
0
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1.00
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63
60
3
3
31
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3207695--3207736
9
4.7
9
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11
50
33
0
4
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1.17
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18
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252
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45
1.75
3211842--3211879
20
1.9
20
88
0
58
57
2
0
39
1.12
3212365--3212412
21
2.3
21
78
7
53
37
4
0
58
1.18
3212410--3212483
30
2.4
32
82
10
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29
5
0
64
1.15
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2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
3218990--3219035
24
1.9
24
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32
4
4
58
1.37
3218928--3219165
26
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26
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17
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28
5
7
58
1.48
3219403--3219464
24
2.5
24
84
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70
30
3
8
58
1.43
3219422--3219478
25
2.3
24
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3
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31
7
5
56
1.49
3223799--3223837
12
2.9
13
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11
53
58
0
0
41
0.98
3223977--3224028
25
2.1
25
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7
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63
5
3
26
1.34
3229792--3229823
2
16.5
2
93
6
57
53
0
0
46
1.00
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18
3.1
18
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53
3
7
35
1.46
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19
3.0
19
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55
3
7
33
1.45
3236919--3236952
16
2.1
17
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11
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5
0.83
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19
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23
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15
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1.84
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25
2.2
26
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9
25
1.55
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2
19.5
2
100
0
78
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0
0
51
1.00
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19
2.8
20
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60
5
0
33
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20
2.1
20
86
0
57
23
2
0
73
0.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
26
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58
7
9
25
1.55
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2
16.0
2
93
6
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48
0
3
48
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2
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2
100
0
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0
0
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1.00
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2.1
19
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4
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22
2
0
75
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0
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2.0
22
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2.0
78
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30
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24
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0
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1.52
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28
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2.4
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29
23
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7.5
75
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104
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2.9
14
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15
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192
2.2
193
93
1
736
26
15
19
38
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3305514--3305647
25
5.3
26
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12
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35
6
2
55
1.42
3305508--3305645
23
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25
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10
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34
6
2
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1.40
3305672--3305736
25
2.8
24
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6
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33
6
6
53
1.50
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16
3.1
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2
2
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1.16
3305890--3305941
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8
82
8
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1
1
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1.14
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7
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0
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19
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0
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0
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50
0
0
50
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410