Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  280  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86574870--86575036
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2.3
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1
605
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25
1.99
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177
2.6
176
86
2
601
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19
26
26
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134
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0
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29
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3
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3
1
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20
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2
44
1.24
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3.9
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86591209--86591378
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2.0
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33
1.91
86611764--86611797
17
1.9
18
88
5
52
50
5
5
38
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86612323--86612379
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70
21
50
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1
1
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1.17
86612313--86612375
25
2.5
23
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34
1
1
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1.15
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2.0
93
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1.9
26
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0
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18
18
24
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1.91
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1.9
19
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10
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1.23
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0
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4.2
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2.0
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0
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2.0
22
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9
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1.98
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80
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30
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22
1.99
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2.8
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23
26
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1.9
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200
23
26
23
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4.7
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17
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2.4
93
83
3
259
27
18
30
23
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4
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28
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1.99
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2.7
27
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23
1.96
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23
2.0
23
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1.80
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7.4
27
82
4
202
23
19
21
35
1.96
86704287--86704483
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2.5
80
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263
23
19
21
35
1.96
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1
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22
22
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43
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36
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13
26
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86734903--86734950
5
9.8
5
84
10
64
0
18
0
81
0.70
86734903--86734951
15
3.3
15
85
0
71
0
18
0
81
0.69
86734903--86734951
11
4.4
10
79
20
53
0
18
0
81
0.69
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3.9
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24
26
17
30
1.97
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94
1.8
94
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0
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24
26
18
30
1.98
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27
2.8
27
81
0
87
38
18
24
18
1.93
86750951--86751092
40
3.5
40
83
7
189
26
26
22
24
2.00
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49
2.4
49
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26
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1.97
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16
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0
0
51
1.00
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21
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2
8
45
1.47
86767540--86767579
17
2.2
18
86
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62
0
5
32
1.17
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18
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0
0
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21
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0
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0
9
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67
2.0
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19
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1.92
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57
2.0
57
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29
2.0
29
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23
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1.85
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141
2.4
139
83
7
372
33
11
28
26
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86811878--86811902
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0
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0
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0
0
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2.0
31
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0
6
57
1.25
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19
1.9
20
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10
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36
15
0
47
1.46
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2.1
30
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20
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1.53
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22
18
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1.97
86819357--86819513
86
1.8
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22
18
26
32
1.97
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85
2.0
86
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7
201
23
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33
1.96
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1.31
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29
22
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1.93
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2.0
28
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74
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28
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10
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43
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20
2.1
20
86
8
59
38
0
0
61
0.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86860377--86860541
82
2.0
82
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0
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31
23
15
29
1.95
86862124--86862202
39
2.0
39
82
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27
12
2
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1.49
86867714--86867793
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0
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2.0
23
100
0
94
34
8
25
31
1.86

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410