Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  394  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
119677003--119677042
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0
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0
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0
0.72
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0
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2.1
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186
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36
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2
4
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2.4
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1.9
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6
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2.2
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0
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1.00
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0
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2.1
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10
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30
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43
1.79
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119711906--119712036
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93
4
221
33
4
24
37
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
119711906--119712036
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5.2
24
92
7
201
33
4
24
37
1.76
119717702--119717789
25
3.5
25
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1
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23
38
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25
2.0
26
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70
38
23
13
25
1.91
119723457--119723537
26
3.2
26
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1
146
30
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25
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119725017--119725066
26
1.9
26
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21
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2
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0
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2.1
24
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7
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47
0
1
50
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2.1
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200
39
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3
51
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1.9
46
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4
115
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36
26
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0
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0
0
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2.7
16
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50
28
4
4
61
1.36
119737719--119738021
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2.3
131
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2
349
28
19
18
33
1.95
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2.4
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85
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217
44
2
15
37
1.60
119740475--119740510
17
2.1
17
100
0
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5
0
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27
20
23
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17
2.1
17
88
0
52
5
14
5
74
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
119759972--119760110
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5.8
24
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20
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26
35
1.94
119759971--119760132
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2.2
72
90
2
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22
17
25
34
1.96
119762774--119762908
39
3.4
39
73
10
114
28
27
20
23
1.99
119764424--119764458
17
2.1
17
88
0
52
5
14
5
74
1.19
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2.6
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90
0
50
52
0
2
44
1.16
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92
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64
50
27
0
22
1.50
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30
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1.8
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5
5
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19
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2
173
48
4
19
27
1.68
Indices
Period
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Copy
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Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
A
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G
T
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(0-2)
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21
28
28
1.98
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1.8
93
93
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39
0
22
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.17
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19.7
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133
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20
22
21
35
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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261
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1.96
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1976
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4.7
24
73
18
86
57
30
0
11
1.40

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410