Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  301  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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48
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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305
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1.99
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27
24
2.00
93247536--93247712
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17
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477
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1.97
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6.2
87
79
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315
32
16
25
25
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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29
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68
1.01
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27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
93362946--93363113
80
2.1
79
87
4
239
23
20
28
27
1.99
93371058--93371225
40
4.2
40
79
12
175
23
21
28
26
1.99
93371058--93371225
80
2.1
79
88
4
248
23
21
28
26
1.99
93380352--93380376
2
12.5
2
100
0
50
52
0
0
48
1.00
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43
1.9
43
90
0
130
28
30
16
24
1.97
93392613--93392858
126
2.0
126
100
0
492
35
13
12
38
1.82
93409711--93409841
29
4.5
29
76
5
113
25
31
17
25
1.97
93411128--93411175
25
2.0
23
84
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8
16
0
75
1.04
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17
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17
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18
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52
0
4
42
1.20
93433665--93433722
25
2.3
26
80
14
75
53
0
3
43
1.17
93433665--93433761
26
3.8
24
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10
77
52
0
3
44
1.16
93435464--93435576
46
2.6
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18
102
27
23
17
31
1.97
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205
2.8
205
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0
945
28
21
18
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1.97
93444661--93444831
46
3.7
46
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7
193
21
21
29
28
1.98
93444660--93444832
93
1.9
93
90
2
276
20
20
30
28
1.98
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0
0
39
0.97
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23
3.0
23
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0
2
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29
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0
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1.24
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29
2.1
29
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12
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49
0
5
45
1.24
93453543--93453634
28
3.3
28
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3
30
7
58
1.42
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43
2.9
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122
30
23
16
29
1.96
93460415--93460498
28
3.0
27
75
6
87
2
26
7
64
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
93460777--93460827
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3.5
15
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10
61
5
29
1
62
1.29
93460778--93460835
28
2.1
28
93
0
98
6
31
1
60
1.33
93461826--93461909
28
3.0
28
79
10
100
5
27
4
61
1.39
93464323--93464398
29
2.7
29
78
10
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25
32
15
26
1.95
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1.9
16
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0
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48
1.62
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29
4.0
30
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9
80
26
29
14
28
1.95
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16
2.7
16
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0
59
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16
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1.75
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16
2.4
17
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10
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48
1.59
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2.6
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30
24
15
29
1.96
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7
131
28
23
18
29
1.97
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28
3.5
27
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2
122
4
23
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1.25
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2.5
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1.80
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2.9
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138
26
23
17
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1.97
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17
2.1
17
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0
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1.50
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175
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25
17
23
1.96
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2.1
15
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0
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18
1.87
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2.0
28
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0
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26
1.83
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2
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0
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0
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1.21
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2.4
18
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52
34
0
0
65
0.93
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4.8
12
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31
0
1
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1.01
93531854--93531911
13
4.3
14
89
8
77
31
0
1
67
1.01
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
93531848--93531913
17
3.9
17
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20
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30
0
3
66
1.06
93531864--93531967
15
7.1
15
73
13
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29
5
0
63
1.24
93531816--93531914
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2.4
41
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12
107
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1
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1.14
93531816--93531910
15
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1
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1.15
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7
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2
0
66
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19
0
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1.10
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14
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18
2.4
18
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52
34
0
0
65
0.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410