Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  377  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
114870163--114870301
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73
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11
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0
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0
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3.5
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103
2.0
103
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1.96
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28
15
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1.96
114872736--114872862
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3.0
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2.0
21
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50
19
26
0
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2.8
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170
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0
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0
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18
1.94
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9
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2
1
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2.0
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4
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20
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2.4
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11
66
63
5
5
25
1.36
114880956--114881015
25
2.4
25
78
10
70
63
5
5
26
1.36
114881117--114881168
19
2.8
18
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16
52
55
3
3
36
1.36
114881133--114881290
43
3.7
43
91
0
228
56
3
6
32
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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19
2.0
19
100
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15
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6
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0
50
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0
0
36
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2.4
21
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0
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0
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42
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1.64
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46
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0
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1.92
114920784--114921058
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460
38
14
24
22
1.92
114920784--114921058
139
2.0
138
92
0
460
38
14
24
22
1.92
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65
2.0
65
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12
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84
10.0
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88
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1056
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20
18
1.94
114927080--114927912
250
3.3
251
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1127
38
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20
18
1.93
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3.3
40
69
22
127
38
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20
20
1.93
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2.1
16
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50
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18
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20
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36
1.63
114930889--114930962
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2.0
37
100
0
148
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13
5
35
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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126
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0
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6
42
1.67
114937049--114937097
20
2.5
20
96
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89
40
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1.78
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16
1.9
18
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0
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19
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7
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78
36
10
19
34
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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0
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2.0
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12
54
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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19
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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24
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0
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52
2
0
45
1.13

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410