Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr13 124041150 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  291  of  410  ( 49152 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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(0-2)
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192
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36
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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1.99
89651764--89651975
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2.1
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1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
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23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89805671--89805891
117
1.9
118
83
2
293
24
21
30
23
1.99
89810873--89810956
26
3.2
26
96
0
150
34
5
23
35
1.80
89812570--89812671
27
3.7
27
83
10
118
19
24
20
35
1.96
89812564--89812678
54
2.1
54
83
3
142
19
23
20
36
1.95
89813961--89814065
30
3.5
30
96
1
185
40
0
24
34
1.56
89816486--89816525
18
2.3
18
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4
55
17
40
20
22
1.92
89817175--89817250
3
25.3
3
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10
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38
2
0
59
1.12
89817836--89817884
18
2.7
18
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0
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28
1.56
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21
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21
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21
19
20
37
1.94
89819404--89819454
22
2.4
22
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59
15
1
27
54
1.52
89825760--89825828
29
2.3
30
78
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1
8
20
1.23
89828281--89828316
18
2.0
18
100
0
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19
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0
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1.18
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45
2.0
45
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23
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16
2.1
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2
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1.44
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0
0
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0
0
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1.00
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0
0
50
1.00
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2.0
23
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0
2
48
1.13
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28
2.2
28
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3
1
64
1.19
89844482--89844554
8
8.8
8
74
14
58
32
1
1
64
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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32
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39
1
0
59
1.08
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55
2.1
55
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1.79
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2.0
40
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0
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1.79
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2.1
12
100
0
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1.93
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27
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1.98
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27
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1.98
89871891--89872046
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41
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11
145
29
28
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1.98
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26
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38
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26
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0
150
33
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1.77
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25
2.0
26
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25
1.91
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1.64
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12
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0
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0
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0
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2.0
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0
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0
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1
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0
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0
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89905922--89905966
21
2.1
21
95
0
81
93
0
6
0
0.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89911062--89911184
58
2.1
58
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185
51
3
0
45
1.17
89911062--89911212
58
2.6
57
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157
52
3
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1.26
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24
2.2
24
96
0
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1.80
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18
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0
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27
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20
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2.2
34
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0
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9
26
1.78

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410