Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  198  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
G
T
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10
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246
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23
16
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1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
60719257--60719477
46
4.7
48
75
13
190
23
27
20
28
1.99
60719257--60719477
94
2.3
94
83
6
268
23
27
20
28
1.99
60721446--60721529
42
2.0
42
100
0
168
40
14
19
26
1.89
60721896--60721924
13
2.2
13
100
0
58
55
13
0
31
1.39
60726403--60726830
48
8.9
48
75
3
378
27
20
29
22
1.98
60726412--60726734
96
3.4
96
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1
434
26
21
30
22
1.98
60728873--60728969
49
2.0
49
93
0
167
20
25
18
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1.95
60729800--60729895
31
3.2
29
80
2
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37
22
15
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1.93
60736453--60736823
48
7.7
48
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478
29
28
16
25
1.97
60739477--60739516
18
2.2
19
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4
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27
10
20
42
1.83
60742225--60742391
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16
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1.96
60742225--60742385
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6
191
31
27
17
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1.97
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40
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1.99
60753208--60753348
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40
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0
228
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60758628--60758666
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1.9
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28
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1.83
60761634--60761784
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43
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15
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1.96
60761615--60761784
43
4.0
43
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150
32
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1.96
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1.95
60774169--60774336
40
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4
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23
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2.00
60782145--60782312
40
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40
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4
178
23
27
23
24
2.00
60785723--60785813
42
2.1
42
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6
103
30
25
12
31
1.92
60794143--60794223
24
3.4
24
82
3
101
22
19
17
40
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
60796295--60796408
28
4.0
29
82
10
130
26
29
15
28
1.96
60796286--60796395
57
1.9
57
85
7
152
25
30
16
27
1.96
60796634--60796669
8
4.5
8
92
0
63
11
22
22
44
1.84
60796619--60796669
16
3.2
16
88
0
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19
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4.0
29
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27
27
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1.95
60806745--60806856
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58
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1
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26
28
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1.96
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1.97
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24
27
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1.98
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2
100
0
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0
0
50
1.00
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2.1
27
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5
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24
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5
0
35
1.22
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2.2
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100
0
52
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15
23
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5.1
41
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20
1.95
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2.2
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1
130
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60818588--60818661
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62
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100
0
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0
0
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1.8
96
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0
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1.9
25
95
0
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12
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20
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20
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2
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60830397--60830444
25
1.9
25
83
8
62
52
2
2
43
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
60830344--60830499
68
2.2
70
76
10
160
50
3
2
42
1.34
60835068--60835117
25
2.0
25
92
0
82
52
24
2
22
1.58
60835272--60835337
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2.0
33
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7
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2.0
33
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5
80
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6
9
33
1.58
60848461--60848527
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2.4
28
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4
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0
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45
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196
21
20
28
28
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410