Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  371  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
113530109--113530138
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2
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0
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50
3
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0
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164
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0
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16
28
1.94
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12
155
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1.84
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12
2.1
12
100
0
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1.94
113538391--113538451
9
6.8
9
88
0
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44
18
9
27
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5
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2.0
18
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0
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0
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0
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1.12
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2.4
23
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3
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11
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1.84
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2.0
23
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40
0
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55
1.20
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10
73
43
0
2
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1.12
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2.0
22
82
4
54
40
2
28
28
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21
1.9
22
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5
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48
0
2
48
1.14
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18
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34
21
25
18
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3
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43
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2.0
23
91
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65
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20
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10
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32
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2.0
22
82
0
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2
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42
1.59
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20
2.5
20
87
3
66
40
2
2
56
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
160
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0
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113624025--113624218
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2.6
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17
180
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3
5
57
1.38
113624152--113624214
9
7.0
9
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13
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38
0
3
58
1.14
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19
2.4
19
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7
65
36
0
2
61
1.09
113624306--113624349
18
2.4
18
88
7
63
36
0
2
61
1.09
113633321--113633354
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5
59
20
5
0
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2.0
20
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15
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2.6
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22
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19
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1.69
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2.1
64
94
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16
16
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1.86
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16
2.2
16
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14
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14
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12
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1.76
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2.9
15
86
0
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15
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4.0
43
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20
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1.78
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27
2.3
26
80
5
66
25
8
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1.70
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3
16.3
3
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12
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2
37
0
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1.09
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26
2.0
26
92
7
86
1
39
0
58
1.09
113639397--113639431
11
3.1
11
84
8
52
2
37
0
60
1.12
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100
0
60
50
0
0
50
1.00
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4.1
47
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246
32
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30
27
1.88
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3.3
25
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22
69
31
8
29
30
1.88
113647123--113647194
22
3.1
22
66
24
58
33
12
29
25
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
113647245--113647488
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5.0
48
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5
27
31
1.80
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146
2.0
143
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6
374
34
7
28
30
1.85
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37
4.9
37
93
1
290
23
19
30
25
1.98
113647638--113647814
75
2.4
74
91
1
282
24
19
31
25
1.98
113650275--113650327
26
2.0
26
100
0
106
47
7
22
22
1.76
113652835--113652918
21
4.2
20
76
11
75
58
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2
35
1.28
113660527--113660601
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2.0
38
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17
17
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1.9
263
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10
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1.87
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14
29
1.95
113664533--113664762
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3.3
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3
261
32
23
14
29
1.95
113664572--113664762
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1.8
104
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30
24
15
29
1.96
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3.5
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28
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1.97
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2
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0
0
50
1.00
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3
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1.31
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27
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9
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1
1
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1.19
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2.8
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4
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0
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19
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2.0
30
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1
0
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1.11
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0
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39
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0
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2.2
13
100
0
58
31
31
0
37
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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24
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2.0
26
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26
0
7
65
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.83
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15
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35
16
10
37
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
22
80
12
59
38
1
7
51
1.42

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410