Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  295  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91068624--91068745
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1.99
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30
85
0
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29
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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18
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58
2
0
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16
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1.14
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0
0
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22
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1.35
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2.3
19
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54
22
20
11
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1.83
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19
2.3
20
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56
28
17
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1.79
91188850--91189057
40
5.2
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218
25
25
22
25
2.00
91188850--91189055
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2.6
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247
25
26
22
25
2.00
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11.9
45
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339
31
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21
30
1.95
91201342--91201883
44
11.9
45
71
10
262
31
16
21
30
1.95
91201337--91201885
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4.0
133
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332
31
16
21
29
1.96
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2.0
20
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4
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2.2
20
91
0
70
22
6
4
65
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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39
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23
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3
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25
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25
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1.97
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2.7
54
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22
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12
100
0
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40
20
24
16
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91242944--91242985
13
3.1
14
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14
9
0
76
1.02
91242990--91243064
3
25.0
3
94
0
132
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1
1
32
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15
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0
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1.25
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27
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1
1
51
1.20
91243504--91243558
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2.3
23
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9
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49
1
0
49
1.11
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2.0
21
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0
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1.65
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2
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2
100
0
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0
0
50
1.00
91247924--91248134
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20
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26
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91247890--91248176
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2.1
137
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91255864--91255973
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26
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1.78
91260803--91260833
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5.2
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96
0
53
64
0
16
19
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19
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28
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28
26
15
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1.96
91272443--91272488
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21
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0
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28
1.74
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29
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1.96
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42
4.2
42
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30
15
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28
1.96
91272735--91272909
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84
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30
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28
1.96
91274688--91274731
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3
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38
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80
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22
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1.99
91288388--91288555
40
4.2
39
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6
194
23
22
28
26
1.99
91293212--91293277
28
2.4
28
94
0
123
15
45
22
16
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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95
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23
28
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27
1.98
91294263--91294627
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48
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14
194
23
29
19
28
1.98
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20
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51
71
5
5
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2.0
31
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2
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26
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18
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1.98
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1.98
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1.97
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0
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24
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2.6
41
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10
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28
26
14
30
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91366234--91366348
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4.0
28
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29
29
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2.7
16
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0
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20
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40
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0
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3.6
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141
29
14
24
30
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410