Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  299  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Period
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Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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21
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26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
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(0-2)
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1.99
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2.1
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1.94
Indices
Period
Size
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Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
92670051--92670134
23
3.8
21
80
12
96
28
21
17
32
1.96
92671569--92671650
41
2.0
41
100
0
164
26
14
19
39
1.90
92673350--92673651
91
3.3
91
84
6
360
29
17
28
24
1.98
92673302--92673709
47
8.7
46
79
11
293
28
17
29
24
1.97
92681022--92681065
21
2.1
21
83
8
54
65
2
6
25
1.28
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56
4.7
56
83
3
343
32
22
15
29
1.94
92691564--92691827
112
2.4
112
88
0
411
32
22
15
29
1.94
92702241--92702315
24
3.1
24
77
7
89
48
18
22
10
1.79
92702241--92702307
8
8.4
8
83
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73
49
19
22
8
1.76
92702248--92702315
8
8.5
8
90
0
64
47
19
23
10
1.80
92702418--92702457
9
4.3
9
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30
20
35
15
1.93
92702539--92702650
29
3.9
29
81
5
138
26
16
32
24
1.96
92702531--92702643
58
2.0
57
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29
15
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23
1.96
92706586--92706665
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25
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7
108
40
16
17
26
1.90
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25
5.5
25
80
0
139
18
13
25
42
1.87
92706930--92707053
50
2.5
50
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160
20
11
25
42
1.85
92714943--92715071
63
2.0
63
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10
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2.0
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0
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1.92
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0
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26
29
12
32
1.93
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40
8.8
40
85
1
461
25
27
21
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92724938--92725287
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2.9
117
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2
475
25
27
21
26
1.99
92724938--92725287
159
2.2
159
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0
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25
27
21
26
1.99
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37
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0
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31
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23
1.98
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47
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0
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29
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1.92
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26
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2
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20
21
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1.95
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0
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1.95
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1.95
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22
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2.1
80
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24
1.99
92743639--92743806
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24
1.99
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2.1
22
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0
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0
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2.0
621
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1.94
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28
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0
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24
2.00
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26
1.98
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29
3.6
29
81
2
118
23
16
32
28
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92782974--92783076
29
3.6
29
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2
118
23
16
32
28
1.96
92786301--92786403
27
3.8
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23
19
1.94
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1.95
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1.99
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5.1
41
58
29
102
33
17
28
20
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410