Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  3  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
650972--651024
23
2.3
23
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6
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58
3
3
33
1.34
651120--651171
12
3.8
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12
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5
5
23
1.36
651980--652086
47
2.3
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1
187
38
37
2
21
1.68
651987--652068
23
3.5
23
69
9
76
36
39
2
21
1.67
652624--652754
44
3.0
44
75
4
147
26
27
15
30
1.96
653140--653314
89
2.0
89
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2
316
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19
22
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653320--653894
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20
17
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1.96
653456--653630
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1.9
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3
235
29
20
17
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1.95
653319--653786
138
3.4
138
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2
692
28
20
17
33
1.95
653877--654075
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68
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0
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23
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2.00
654080--654818
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8
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20
22
20
35
1.96
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129
2.2
130
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19
21
22
37
1.94
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15.7
43
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369
20
22
21
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1.96
654877--654997
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1.9
65
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6
187
35
12
18
33
1.88
656647--656688
7
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20
50
0
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0
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0.65
656647--656688
14
2.8
15
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10
59
0
16
0
83
0.65
656645--656689
21
2.0
23
91
8
76
0
17
0
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2.5
20
89
6
71
42
8
21
27
1.81
661579--661953
132
2.8
132
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3
445
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15
19
31
1.93
662229--662281
3
17.7
3
84
0
70
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1
3
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1.22
662400--662453
23
2.3
23
81
6
65
55
3
7
33
1.45
663411--663517
47
2.3
47
95
1
187
38
37
2
21
1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
663418--663499
23
3.5
23
69
9
76
36
39
2
21
1.67
670411--670455
23
2.0
22
86
4
63
42
15
0
42
1.47
672385--672422
20
1.9
20
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10
51
52
10
5
31
1.58
683646--683707
28
2.2
28
97
0
115
33
12
3
50
1.57
684155--684192
18
2.1
18
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0
76
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0
0
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3
11.0
3
100
0
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33
0
33
33
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698838--698902
30
2.2
31
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5
89
30
6
13
49
1.67
703249--703335
34
2.6
34
78
10
97
49
1
1
48
1.16
703249--703343
7
14.1
7
73
16
67
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1
1
47
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13.3
3
100
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0
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704542--704585
22
2.0
23
90
4
72
18
22
20
38
1.93
706009--706042
17
2.0
17
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52
32
0
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717250--717288
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2.0
20
85
10
53
64
2
20
12
1.40
719224--719278
23
2.3
23
77
17
60
47
7
1
43
1.41
720710--720742
16
1.9
18
88
11
52
15
18
0
66
1.25
726200--726230
13
2.3
14
94
5
55
51
6
0
41
1.27
726266--726314
21
2.3
23
86
10
68
65
2
0
32
1.04
726788--726821
14
2.2
16
85
15
54
47
0
52
0
1.00
726782--726834
22
2.4
22
78
12
63
45
0
54
0
0.99
726915--726959
8
5.2
8
82
12
54
20
0
2
77
0.87
727346--727393
24
2.0
24
92
4
80
10
2
54
33
1.46
727346--727404
23
2.5
24
89
5
86
11
3
50
33
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
728067--728242
73
2.4
72
72
8
160
30
21
18
29
1.97
728202--728349
54
2.8
53
83
8
196
37
19
15
27
1.92
728309--728522
88
2.5
86
85
5
279
35
21
16
26
1.94
728591--728952
75
4.9
73
77
9
283
33
23
16
26
1.96
741421--741451
13
2.3
14
94
5
55
51
6
0
41
1.27
741487--741535
21
2.3
23
86
10
68
65
2
0
32
1.04
742009--742042
14
2.2
16
85
15
54
47
0
52
0
1.00
742003--742055
22
2.4
22
78
12
63
45
0
54
0
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23
2.5
24
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5
95
10
3
52
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1.52
751208--751525
131
2.4
130
82
2
343
33
18
20
27
1.96
751309--751557
130
1.9
131
89
0
392
30
19
20
28
1.97
753550--753579
14
2.1
15
93
6
53
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0
13
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2.3
24
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2.0
21
85
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57
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0
4
60
1.18
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2.3
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134
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11
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0
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0
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12
2.3
12
100
0
56
60
7
10
21
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
801447--801490
20
2.2
20
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0
0
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4
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14
23
26
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15
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13
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5
283
30
16
24
28
1.97
827884--828339
233
2.0
233
96
0
849
29
17
22
30
1.96
828207--828340
71
1.9
71
90
0
214
30
16
23
29
1.96
828053--828656
159
3.8
159
95
1
1016
28
17
22
31
1.96
828366--828499
71
1.9
71
90
0
214
30
16
23
29
1.96
828525--828801
73
3.8
74
88
3
368
31
18
21
28
1.97
828207--828801
159
3.9
144
89
5
460
29
17
21
30
1.96
829733--829768
16
2.3
16
90
4
56
88
2
8
0
0.59
829759--829803
18
2.5
18
82
7
56
64
26
2
6
1.30
830605--830638
14
2.3
15
90
5
52
38
0
2
58
1.13
843432--843471
22
1.9
21
90
10
64
25
20
5
50
1.68
843934--843958
13
1.9
13
100
0
50
48
0
4
48
1.20
845675--845708
17
2.0
17
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0
50
82
2
14
0
0.79
851817--851874
29
2.0
29
86
0
80
32
15
13
37
1.87
853574--853614
22
1.9
21
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5
55
29
2
9
58
1.43
859154--859244
18
5.1
18
89
0
137
34
10
20
34
1.88
860197--860266
33
2.1
33
100
0
140
40
21
14
24
1.90
868813--868872
28
2.1
28
93
0
102
41
13
10
35
1.78
888012--888126
44
2.6
44
85
2
149
35
13
22
27
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
888012--888145
46
3.0
45
82
4
153
35
14
23
26
1.93
907906--907958
18
2.9
18
88
0
79
26
15
24
33
1.95
911363--911404
20
2.0
20
82
13
50
42
4
2
50
1.36
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23
2.0
24
88
8
71
42
17
0
40
1.49
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20
2.0
20
100
0
82
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9
24
1.85
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2.2
13
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0
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28
0
0
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110
2.0
110
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0
439
17
13
15
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1.73
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2.1
31
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0
121
33
3
32
30
1.73
953791--953825
16
2.1
17
89
5
54
25
22
5
45
1.74
957349--957539
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2.0
94
100
0
382
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27
11
13
1.77
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2
12.5
2
100
0
50
48
0
0
52
1.00
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3
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3
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1
28
0
69
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32
2.8
32
79
1
90
68
6
5
18
1.32
962876--962961
11
8.0
11
79
5
68
68
5
5
19
1.31
967355--967388
2
17.0
2
100
0
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0
0
50
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2.2
12
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0
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0
40
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2
20.0
2
100
0
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0
50
0
1.00
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56
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7
165
44
0
1
53
1.10
981596--981657
20
3.2
20
84
6
76
35
0
4
59
1.19
982950--982987
19
2.1
19
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5
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23
2
2
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1.12
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29
2.0
30
83
9
77
35
20
1
42
1.62
985653--985709
24
2.2
26
78
15
64
49
22
1
26
1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
985668--985714
25
1.9
24
83
12
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48
25
2
23
1.62
1002156--1002255
51
2.0
51
100
0
200
42
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6
34
1.74
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11.3
3
100
0
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0
0
32
0.91
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3
13.7
3
100
0
82
65
0
0
34
0.93
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2.0
24
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20
2
22
1.54
1015089--1015118
8
3.8
8
100
0
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36
36
13
13
1.84
1019074--1019131
22
2.6
22
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0
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29
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1.53
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13.7
3
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2
0
60
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1.9
21
90
10
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25
10
2
62
1.39
1020445--1020497
21
2.3
24
75
21
60
28
7
1
62
1.33

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410