Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  27  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6856871--6856929
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22
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1.99
6856981--6857122
70
2.0
71
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22
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2.1
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5.4
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6.0
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2.1
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0
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2.7
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24
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1.9
32
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26
21
22
29
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
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1.95
6876948--6877062
54
2.1
54
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178
36
22
23
17
1.95
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25
2.7
25
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4.2
26
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0
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24
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1.81
6882709--6882823
27
4.3
26
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149
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23
16
1.94
6882709--6882823
54
2.1
54
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3
169
36
23
23
16
1.94
6884441--6884524
26
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26
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5
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5
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2
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6885815--6885930
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2
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206
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19
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26
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1
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1.08
6916056--6916142
37
2.3
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5
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19
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1.97
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25
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0
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159
34
24
24
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1.95
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2.2
39
91
4
138
43
22
20
12
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
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1
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1.97
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173
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28
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0
26
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6956797--6956842
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0
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0
0
51
1.00
6959468--6959495
14
2.0
14
100
0
56
50
7
14
28
1.69
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13
3.3
13
90
9
63
70
0
0
29
0.88
6965909--6965941
7
4.9
7
92
7
59
72
0
0
27
0.85
6965904--6965940
10
3.8
10
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16
51
72
0
0
27
0.84
6965909--6965946
20
2.0
20
94
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73
0
0
26
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17
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17
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9
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5
1
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46
1.35
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10
2.6
10
100
0
52
69
0
7
23
1.14
6972589--6972717
44
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152
34
13
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1.93
6978733--6978861
44
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45
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152
34
13
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27
1.93
6985345--6985384
6
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2
0
20
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6985345--6985384
19
2.1
19
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0
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2
0
20
0.88
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19
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19
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19
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75
1
0
22
0.89
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13
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13
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73
1
0
25
0.92
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6
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10
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25
0
0
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1.12
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20
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0
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10
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28
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0
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1.16
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99
3.0
98
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1
486
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15
15
32
1.90
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20
3.5
20
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77
39
20
18
21
1.93
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16
2.2
15
89
5
50
32
2
2
61
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7002456--7002594
69
2.0
69
98
0
269
15
17
13
53
1.74
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17
2.5
15
87
8
51
74
5
15
5
1.17
7012361--7012398
16
2.3
17
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4
51
76
5
13
5
1.13
7013252--7013290
18
2.2
17
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4
51
51
5
0
43
1.24
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30
2.2
33
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2
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1.50
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30
2.1
30
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1.44
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29
2.2
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1
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1.59
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29
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29
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43
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13
2.1
14
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55
10
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34
1.34
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9
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17
141
35
3
15
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1.62
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16
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16
66
19
161
35
3
15
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1.62
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313
33
2
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1.59
7027777--7027945
49
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36
2
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30
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4
15
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1.65
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81
2.2
81
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0
327
36
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1.61
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46
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213
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1.67
7028050--7028162
34
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33
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117
37
1
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1.59
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17
2.0
17
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0
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5
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1.51
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14
2.3
15
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11
2
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1.53
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27
5.9
27
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11
175
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22
23
18
1.96
7031381--7031524
54
2.7
54
93
2
236
35
23
23
17
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7033936--7034053
37
3.2
37
90
0
182
24
13
47
14
1.80
7033971--7034031
18
3.3
18
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13
52
21
14
50
13
1.76
7034945--7034979
14
2.5
14
90
0
52
51
31
0
17
1.45
7037658--7037706
15
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13
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42
0
0
57
0.99
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2.6
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2
3
47
1.30
7037545--7037704
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2.9
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159
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1
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48
1.28
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7.2
43
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17
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29
1.97
7041000--7041311
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86
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25
17
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1.98
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126
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26
17
26
30
1.97
7041111--7041337
43
5.3
43
78
4
217
23
18
27
30
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410