Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  114  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.5
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26
18
32
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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33975832--33976044
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4.5
48
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3
308
26
22
23
27
1.99
33975832--33976044
71
3.0
71
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3
304
26
22
23
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1.99
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92
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28
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2.1
22
84
4
58
12
4
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74
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.96
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27
1.91
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1.97
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40
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28
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1.99
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20
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26
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2.4
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33
17
24
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
34123341--34123413
29
2.5
29
93
0
101
26
31
16
26
1.96
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40
3.8
40
77
13
134
27
23
26
22
2.00
34132794--34132923
40
3.2
40
77
4
138
24
23
27
23
2.00
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27
6.3
27
88
2
169
39
19
17
24
1.92
34137902--34138071
81
2.1
81
80
2
189
39
19
17
24
1.92
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40
2.2
40
82
7
121
23
23
28
24
1.99
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2
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2
100
0
90
48
0
0
51
1.00
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2.3
26
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23
16
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2.0
30
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20
28
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94
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26
19
31
22
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19
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1.98
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2.5
42
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0
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20
29
1.93
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40
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25
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26
1.99
34209428--34209611
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2.3
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80
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26
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26
1.99
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29
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25
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1.9
22
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0
57
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0
26
33
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
34235261--34235369
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12
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1.9
21
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1.83
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21
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1.94
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2.0
25
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0
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0
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1.99
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17
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34251965--34252003
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1.99
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27
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29
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1.94
34271892--34271992
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3.5
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116
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1.94
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105
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0
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0
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1.9
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2
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104
2.7
98
89
6
423
39
5
3
51
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
34282763--34282870
9
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9
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37
1.62
34282771--34282867
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6.1
16
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1.64
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54
0
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Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410