Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  26  of  410  ( 49152 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6626187--6626242
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28
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0
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0
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2.9
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0
0
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0
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2.4
44
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3
144
29
23
13
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2.0
34
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0
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2.0
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0
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0
0
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2.1
19
100
0
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71
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10
12
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
21
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18
27
27
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21
2.0
21
85
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38
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38
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17
20
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9
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0
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0
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1.53
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2.1
22
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22
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10
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18
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2.4
216
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20
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3.0
41
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2.6
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80
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30
9
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42
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20
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115
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13
1
28
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1.9
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1.9
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88
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23
25
25
26
2.00
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21
2.2
20
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4
54
55
0
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4
1.20
6742677--6742722
21
2.1
22
92
4
76
58
6
0
34
1.24
6742677--6742767
22
4.1
22
74
16
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62
4
3
29
1.30
6742677--6742732
21
2.6
21
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8
60
60
7
0
32
1.24
6743177--6743226
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8.3
6
77
16
50
66
32
0
2
1.03
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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1.00
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3
0
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1.22
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40
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13
99
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1
2
58
1.19
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2.6
16
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25
5
2
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1.23
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3.1
22
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10
59
26
10
5
57
1.55
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2.7
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141
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17
25
29
1.98
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43
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204
29
19
22
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1.98
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276
28
18
23
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1.98
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2.7
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107
30
17
23
27
1.97
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225
1.8
224
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2
489
32
21
19
26
1.97
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11
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53
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34
0
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1.12
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1.50
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209
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4
1
63
1.24
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4.3
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0
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0
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32
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4
60
1.30
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1.15
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18
1.9
18
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25
2.0
25
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4
64
59
2
4
34
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6764032--6764080
25
2.0
25
84
8
64
61
4
2
32
1.26
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17
1.9
17
93
0
57
33
0
3
63
1.10
6767301--6767351
24
2.2
22
80
13
59
25
13
5
54
1.61
6767400--6767489
27
3.4
25
72
14
74
34
8
1
55
1.38
6768458--6768565
26
4.2
25
90
7
171
33
7
23
36
1.83
6768458--6768565
52
2.1
52
94
0
189
33
7
23
36
1.83
6775502--6775608
26
4.2
25
91
5
178
32
7
23
36
1.83
6783279--6783349
35
2.0
35
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0
106
26
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15
50
1.69
6784955--6784986
3
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3
87
12
50
65
0
0
34
0.93
6788965--6789031
25
2.8
24
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10
102
38
0
17
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1.50
6794432--6794472
22
1.9
22
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46
24
0
29
1.53
6795050--6795097
21
2.3
21
79
13
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66
6
22
4
1.32
6795073--6795122
23
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23
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2
20
4
1.08
6795970--6796003
6
5.7
6
89
0
50
17
17
14
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1.79
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18
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18
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0
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23
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1.92
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24
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0
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1.9
17
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79
2
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8
1.03
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21
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6
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0
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1.79
6801765--6801809
18
2.5
18
92
0
81
22
15
11
51
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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15
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0
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0
0
31
0.90
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22
2.4
22
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6
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33
5
0
60
1.21
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9
5.5
10
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7
0
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1.21
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15
2.5
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28
0
2
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1.03
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0
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0
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0
0
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1.00
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0
0
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2.0
26
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1.21
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0
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100
0
0
0
0.00
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25
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1.70
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2
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60
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21
0
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1.19
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2
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0
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0
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0
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0
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22
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0
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0
0
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3.5
15
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50
0
0
49
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6830814--6830907
38
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3
12
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1.59
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22
2.0
22
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7
4
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1.47
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29
2.0
25
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20
11
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1.60
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1.9
25
86
0
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1.96
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100
0
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24
6.0
24
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4
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28
22
22
26
1.99
6848899--6849041
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3.0
47
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5
207
28
22
22
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1.99
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220
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22
22
26
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0
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1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410