Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  31  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
9
19
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1.82
7779140--7779429
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101
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19
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1.9
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23
1.9
23
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58
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1.8
93
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317
20
22
30
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4
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0
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2
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1.10
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2.1
38
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2
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7806958--7807075
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2
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20
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19
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1
62
1.20
7807235--7807407
19
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20
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3
1
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7807334--7807456
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10
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7808103--7808161
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5
20
47
1.71
7808103--7808162
9
6.7
9
81
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59
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20
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20.5
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0
0
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2.1
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1.84
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2.3
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81
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41
1
0
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1.06
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2
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2.0
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35
11
19
32
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
21
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54
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1.9
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18
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2.0
19
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20
21
29
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7862708--7862879
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2
0
45
1.13
7884545--7884627
38
2.2
39
80
8
98
51
1
1
45
1.16
7884581--7884610
11
2.7
11
94
0
51
60
0
0
40
0.97
7893533--7893574
16
2.7
16
74
3
50
40
0
2
57
1.12
7902379--7902417
17
2.3
17
81
0
51
74
2
7
15
1.15
7912720--7912873
69
2.2
69
89
0
236
44
15
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35
1.65
7912755--7912864
37
3.1
36
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21
97
46
17
3
32
1.65
7916484--7916549
31
2.1
31
94
0
114
54
22
7
15
1.66
7920298--7920362
34
2.0
34
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6
89
30
26
16
26
1.97
7920669--7920721
26
2.0
27
85
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74
24
15
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1.92
7922187--7922247
32
1.9
32
100
0
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4
32
1.76
7923904--7924028
43
2.9
43
90
2
189
24
16
29
29
1.97
7928047--7928083
15
2.5
15
91
8
58
75
0
16
8
1.02
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13
2.5
13
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0
0
46
1.00
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37
2.4
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2
26
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7931262--7931294
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16
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0
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0
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0
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20
2.2
21
84
7
58
35
11
0
53
1.37
7938914--7939042
44
2.8
45
82
4
152
34
13
24
27
1.93
7944852--7944980
44
2.8
45
82
4
152
34
13
24
27
1.93
7952998--7953173
71
2.4
73
86
3
241
30
16
23
28
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7953293--7953535
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3.3
72
77
7
222
31
16
21
30
1.95
7953503--7953645
77
1.9
76
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7
182
25
13
14
46
1.81
7954825--7954896
33
2.1
35
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10
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2
2
30
1.22
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16
2.1
16
100
0
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0
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0
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0
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0
0
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11
0
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27
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0
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1.75
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2.0
26
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0
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16
4.3
14
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3
0
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1.11
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1.19
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19
4.6
18
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22
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32
3
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62
1.19
7975140--7975239
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112
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3
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1.17
7979100--7979207
26
4.2
26
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0
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24
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1.83
7982727--7982758
2
16.0
2
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0
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3
0
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1.17
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1.71
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20
2.5
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1.97
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6
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32
2.1
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0
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12
0
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1.32
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20
2.9
20
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5
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33
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2.3
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20
23
19
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1.94
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24
2.3
24
81
6
69
19
25
16
39
1.91
7999728--7999839
27
4.1
27
78
7
120
37
22
24
16
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7999728--7999839
54
2.1
54
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3
136
37
22
24
16
1.93
8007663--8007836
87
2.0
87
98
0
339
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20
12
33
1.90
8010852--8010893
20
2.0
21
86
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50
4
11
33
1.60
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0
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0
0
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4.1
68
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4
317
35
16
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25
1.95
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1.9
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100
0
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0
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0
0
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2
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1.9
18
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0
61
20
2
0
77
0.90

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410