Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  286  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.76
Indices
Period
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Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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23
1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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20
22
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Indels
Score
A
C
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(0-2)
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293
28
20
22
28
1.98
88197238--88197294
9
5.9
9
73
15
51
35
21
8
35
1.84
88197226--88197296
20
3.5
20
94
0
124
32
21
11
35
1.89
88197231--88197285
11
5.4
11
70
16
55
30
20
12
36
1.90
88197333--88197380
25
1.9
25
86
0
69
27
18
22
31
1.97
88198621--88199204
27
21.6
27
85
3
665
40
8
21
28
1.83
88198622--88199204
81
7.2
81
85
3
753
40
8
21
28
1.83
88212249--88212481
59
3.9
58
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6
189
30
22
10
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1.87
88212613--88212710
50
2.0
50
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0
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88223461--88223607
53
2.7
53
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4
170
21
23
19
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1.96
88223593--88223715
47
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47
85
0
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24
21
16
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1.93
88229638--88229831
55
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54
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4
203
20
23
17
38
1.93
88229810--88229931
47
2.6
47
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0
208
25
24
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1.93
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39
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39
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256
23
23
27
24
2.00
88240805--88241023
40
5.4
40
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3
269
24
22
27
26
2.00
88240800--88241023
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2.8
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8
265
24
22
26
26
2.00
88248946--88249054
26
4.2
26
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1
184
33
5
24
35
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137
2.1
136
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1.97
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25
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25
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3
171
34
3
25
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1.74
88254822--88254929
51
2.1
51
92
0
180
34
3
25
37
1.74
88256713--88256997
137
2.1
135
97
1
430
24
18
25
31
1.98
88264440--88264583
39
3.7
39
90
0
234
26
21
29
22
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
79
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1
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24
21
29
24
1.99
88268636--88268736
28
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28
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0
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34
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1.90
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4.0
7
100
0
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0
28
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2.5
16
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0
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1.94
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20
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1.93
88292424--88292589
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23
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1.95
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74
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0
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0
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16
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1.96
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2.00
88321572--88321778
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25
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24
2.00
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31
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1
138
24
26
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1.97
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29
20
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0
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2.3
13
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0
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0
23
0
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0
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27
2.0
27
82
6
67
49
1
25
23
1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
88344387--88344557
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1.8
93
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0
270
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30
1.97
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3.7
46
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21
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29
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1.96
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24
1.9
24
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2
43
1.65
88350119--88350294
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3.8
46
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155
19
17
30
32
1.94
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2.4
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0
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2.1
36
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0
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12
10
16
1.57

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410