Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  260  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Score
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20
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Score
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1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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29
2.6
29
95
0
130
45
1
0
52
1.09
80455433--80455517
15
5.8
15
73
15
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44
1
0
54
1.07
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44
7.4
44
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11
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12
2
37
1.53
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53
6.6
54
84
8
386
48
12
2
37
1.53
80455630--80455968
97
3.6
96
86
7
505
48
12
2
37
1.53
80455648--80455961
9
35.6
10
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199
47
11
2
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80455680--80455942
26
10.0
26
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163
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12
1
38
1.52
80457838--80457862
12
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1.98
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43
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25
17
28
1.97
80470719--80470761
19
2.3
19
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4
52
25
2
2
69
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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17
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21
3
1
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1.08
80470734--80470788
6
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3
1
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29
1.97
80470990--80471265
85
3.3
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281
25
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0
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1.98
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1.92
80475714--80475895
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80
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79
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1.99
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1.94
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15
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31
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2.1
28
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1.95
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28
3.5
29
86
6
125
29
27
13
28
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5.3
54
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24
28
1.99
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108
2.5
108
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24
28
1.99
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2.6
37
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0
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39
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1.88
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1.98
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192
28
26
21
23
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410