Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
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This is table  389  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
118057782--118058185
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3.1
132
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0
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25
19
28
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15
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13
0
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50
1.42
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5.3
29
96
3
280
36
14
23
25
1.92
118068810--118068966
59
2.7
58
96
4
280
36
14
23
25
1.92
118072648--118072867
29
7.6
29
93
1
361
34
15
20
30
1.93
118080512--118080731
29
7.6
29
94
0
377
33
15
21
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1.94
118083922--118084574
132
5.0
132
79
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588
34
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19
27
1.95
118083951--118084574
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2.4
264
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19
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4.2
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93
0
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50
0
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2
1.12
118098121--118098174
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3.0
18
83
0
72
48
0
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0
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0
50
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0
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3.1
17
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39
3
1
54
1.29
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21
2.1
22
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67
71
0
6
22
1.09
118118724--118118766
20
2.1
21
86
4
61
53
0
2
44
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
118118849--118118889
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2.2
20
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12
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31
2
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58
1.38
118118867--118118909
22
2.0
23
86
9
63
32
2
4
60
1.30
118123182--118123212
14
2.2
14
100
0
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25
16
12
45
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11
2.4
11
100
0
52
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0
0
15
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47
2.4
47
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154
25
16
23
35
1.95
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1.9
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7
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46
8
2
42
1.47
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59
2.7
58
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2
224
35
24
19
20
1.96
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2.0
26
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0
0
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14
0
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51
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10
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1.68
118169966--118170003
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52
13
0
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1.40
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26
4.2
26
97
0
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1.79
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2
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0
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48
0
0
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50
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50
92
0
346
35
15
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27
1.94
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31
6.8
31
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3
280
27
18
26
27
1.98
118186495--118186618
47
2.7
46
83
2
149
28
15
26
29
1.96
118186577--118186708
49
2.9
48
83
8
159
27
13
28
31
1.94
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42
2.6
42
87
2
152
30
11
27
30
1.92
118186657--118186752
42
2.3
42
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5
113
33
14
22
29
1.94
118188750--118188808
29
2.0
29
96
0
109
37
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5
50
1.51
118200128--118200165
2
19.5
2
94
5
69
52
0
0
47
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
118210011--118210040
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46
0
0
53
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92
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19
27
28
1.99
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39
3.9
39
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1
119
22
20
28
28
1.99
118210480--118210639
78
2.1
78
79
4
171
23
19
27
29
1.98
118214070--118214245
46
3.8
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212
21
21
29
28
1.98
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1.8
93
94
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308
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21
30
27
1.98
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5.4
15
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10
17
13
58
1.63
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3.0
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95
10
17
16
56
1.67
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10
212
21
21
29
28
1.98
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1.8
93
94
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308
20
21
30
27
1.98
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19
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0
20
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24
2.0
24
92
7
82
38
20
22
18
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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18
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0
0
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1.00
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22
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10
12
34
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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8
138
33
18
29
17
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
118365945--118366084
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3.4
19
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18
78
58
1
6
33
1.33

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410