Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  327  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101578595--101578644
20
2.4
22
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34
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1.84
101580977--101581010
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2.1
16
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0
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2
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38
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0
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24
2.4
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24
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101583872--101583944
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2.1
35
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0
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5
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1.72
101584753--101584805
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1
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0
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54
1.10
101584751--101584806
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4.5
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10
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18
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11
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0
29
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1.54
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0
0
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100
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0
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1.9
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10
62
45
2
0
52
1.14
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2.0
56
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29
1.97
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22
2.8
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67
16
5
10
1.38
101596293--101596360
23
2.9
24
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6
77
67
16
5
10
1.38
101599338--101599415
27
2.9
27
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0
111
37
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30
1.88
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17
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1
1
31
1.15
101605886--101606136
23
10.4
23
66
23
76
59
1
4
34
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101605992--101606063
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2.3
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2
5
30
1.33
101606076--101606148
3
24.0
3
73
22
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64
0
0
35
0.94
101605886--101606148
11
24.6
11
65
25
70
60
1
4
33
1.27
101606076--101606144
27
2.7
25
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20
79
63
0
0
36
0.94
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19
6.1
18
70
20
73
64
0
2
31
1.12
101608684--101608753
27
2.5
28
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2
124
28
14
27
30
1.95
101608684--101608765
27
3.0
27
85
8
78
29
15
24
30
1.96
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0
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3
0
73
0.98
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14
125
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1
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20
2.1
21
91
4
70
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4
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1.59
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19
2.0
19
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0
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13
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1.92
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22
2.2
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58
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21
8
34
1.84
101618673--101618751
19
4.2
19
90
9
126
35
16
10
37
1.82
101618673--101618745
36
2.0
38
94
5
132
35
15
10
38
1.82
101618674--101618761
36
2.4
35
85
14
117
35
15
10
38
1.82
101619781--101619859
19
4.2
19
87
9
117
39
10
15
35
1.81
101619771--101619858
36
2.4
36
78
17
110
39
10
14
35
1.80
101622453--101622495
23
1.9
23
85
4
61
39
2
18
39
1.64
101626042--101626088
24
2.0
24
91
0
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34
29
12
23
1.92
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24
2.6
24
89
0
90
31
34
14
19
1.91
101631673--101631752
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3.1
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60
23
64
35
17
17
30
1.93
101631643--101631874
49
4.7
49
90
1
338
31
18
18
31
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101636678--101636738
27
2.3
27
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81
22
22
16
37
1.93
101643745--101643851
26
4.2
26
89
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148
33
5
24
36
1.79
101643754--101643849
49
2.0
49
93
0
165
30
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26
37
1.81
101645637--101645923
137
2.1
137
97
0
538
24
18
24
32
1.97
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22
2.0
22
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59
0
4
36
1.17
101668525--101668573
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2.0
24
96
0
89
24
22
16
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101668535--101668583
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2.0
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0
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20
12
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2.0
213
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0
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0
86
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1.80
Indices
Period
Size
Copy
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Percent
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Percent
Indels
Score
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G
T
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(0-2)
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31
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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24
24
33
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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0
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29
22
17
29
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410