Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  33  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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0
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Indices
Period
Size
Copy
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Size
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Indels
Score
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2.3
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2.8
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38
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2.1
29
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29
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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1
36
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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51
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21
1.94
8416646--8416783
41
3.3
41
89
6
206
37
23
18
19
1.94
8419740--8419781
14
3.0
14
82
0
57
52
0
35
11
1.38
8419957--8420233
114
2.4
113
78
8
294
36
23
15
25
1.94
8420031--8420289
114
2.3
115
81
4
292
35
19
16
28
1.94
8421129--8421181
21
2.5
22
75
9
56
50
22
1
24
1.59
8421743--8421914
40
4.3
40
77
3
159
26
19
18
34
1.95
8422094--8422155
30
2.1
30
100
0
124
37
19
3
40
1.68
8423727--8423761
18
1.9
18
94
0
61
71
2
0
25
1.00
8428806--8428980
66
2.7
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3
237
23
42
4
30
1.72
8428734--8428989
33
7.8
33
68
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133
23
40
4
31
1.75
8433585--8433639
23
2.4
22
79
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56
18
5
3
72
1.18
8434311--8434343
11
2.9
12
86
13
52
33
0
0
66
0.92
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25
2.4
23
78
18
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56
8
1
33
1.41
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30
2.0
30
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102
57
8
3
30
1.45
8436230--8436291
22
2.6
24
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16
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43
0
0
56
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15
2.0
15
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0
51
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3
0
30
1.07
8442573--8442609
2
18.5
2
100
0
74
48
0
0
51
1.00
8446157--8446221
21
3.1
21
78
8
62
61
0
4
33
1.16
8446159--8446219
28
2.2
29
77
19
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59
0
4
36
1.19
8446165--8446223
21
2.8
21
78
14
68
59
0
3
37
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.5
13
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10
55
64
0
0
35
0.94
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16
2.0
15
93
6
53
64
0
0
35
0.94
8446578--8446657
17
4.5
18
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12
94
37
11
10
41
1.74
8446569--8446616
19
2.5
20
77
22
57
35
14
8
41
1.76
8449966--8450014
8
5.8
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2
16
1.01
8449966--8450014
17
2.9
16
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53
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4
2
16
1.01
8454371--8454429
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0
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5
8
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1.55
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2
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2
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0
0
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1.72
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2
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2
100
0
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0
0
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1.00
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20
1.48
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17
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4
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0
0
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3.1
20
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1
0
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1.10
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23
2.0
24
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4
62
47
6
0
45
1.27
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5
85
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19
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1.9
31
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93
38
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38
1.74
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4.6
46
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277
20
22
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4.2
11
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0
0
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0.94
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24
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60
1
0
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1.9
49
93
0
161
34
11
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8490363--8490464
49
2.1
49
88
3
152
33
12
19
34
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8490317--8490489
91
1.9
91
84
0
229
34
12
20
33
1.89
8497999--8498042
18
2.6
17
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72
45
0
0
54
0.99
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24
2.1
23
82
10
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60
6
2
32
1.32
8501515--8501607
3
31.3
3
72
20
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2
2
27
1.13
8501515--8501597
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12
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2
2
28
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8501520--8501606
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2.3
38
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2
104
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2
2
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0
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22
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113
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0
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0
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8502006--8502121
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13
71
23
88
15
0
47
37
1.46

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410