Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  2  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
405526--405654
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407935--408203
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2.9
92
92
1
423
21
23
13
42
1.88
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2.0
72
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0
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24
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2.0
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100
0
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26
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0
0
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2.8
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1.90
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1.9
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15
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1.9
315
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1119
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21
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11.8
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74
14
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18
20
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1.9
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100
0
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0
50
17
20
5
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1.8
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247
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19
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1.9
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100
0
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14
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18
20
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1.96
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14
504
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17
18
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93
1.8
92
87
3
248
27
19
20
32
1.97
439182--439585
72
5.5
73
89
2
483
31
16
19
32
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
440454--440547
31
3.0
32
89
4
138
72
19
4
4
1.18
440454--440538
32
2.7
32
94
3
145
71
20
4
3
1.19
440480--440535
19
3.3
19
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27
61
73
17
5
3
1.17
441105--441129
2
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2
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0
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0
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1.00
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3
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441028--441160
39
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15
112
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6
4
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1.46
441166--441207
21
2.0
20
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4
57
33
7
7
52
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3.7
18
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14
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5
42
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2.0
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100
0
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40
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7
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21
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16
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38
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7
46
1.61
445656--445721
22
3.2
22
70
16
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9
46
1.64
451810--451883
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2.7
27
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10
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27
2.0
29
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2
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2
100
0
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0
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1.00
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134
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0
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0
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0
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48
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2.0
17
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5
50
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18
0
0
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2.0
26
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70
51
0
3
44
1.19
463401--463441
21
1.9
21
90
5
64
29
7
4
58
1.46
463403--463449
21
2.4
18
83
16
58
27
6
4
61
1.39
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21
2.7
21
83
11
69
55
0
0
44
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
26
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0
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1
15
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1.54
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0
58
51
0
0
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1.00
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144
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23
13
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44
2.4
44
87
3
144
29
23
13
33
1.93
487154--487216
31
2.0
31
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0
117
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11
22
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1.89
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137
2.1
136
96
0
527
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24
19
24
1.98
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1
261
38
24
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33
1.75
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26
5.2
26
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0
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23
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17
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0
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12
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526066--526150
17
4.7
17
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18
57
37
2
1
58
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
526068--526140
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0
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0
4
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17
5.8
19
71
13
51
51
0
3
43
1.26
540221--540256
17
2.1
18
89
5
56
52
0
0
47
1.00
540169--540311
70
2.0
71
94
1
252
48
2
2
46
1.28
540280--540349
21
3.4
20
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11
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40
1
0
58
1.07
540369--540401
17
1.9
17
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11
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45
0
3
51
1.16
548720--548757
20
1.9
19
89
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58
28
13
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52
1.61
553128--553187
18
3.3
18
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4
77
21
23
20
35
1.96
556308--556341
14
2.2
16
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10
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26
23
23
26
2.00
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2.0
26
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7
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15
20
37
1.92
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32
2.0
32
100
0
130
38
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30
1.80
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119
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119
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0
1244
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0
139
28
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1.9
83
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19
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1.94
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11
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11
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24
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32
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2
60
1.30
571873--571988
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2.4
47
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11
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2
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36
2.0
38
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105
31
4
1
62
1.23
572016--572053
20
1.9
19
85
15
51
34
0
2
63
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
21
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0
70
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0
2
31
1.05
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2.1
22
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11
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37
0
8
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1.8
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0
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27
29
21
20
1.98
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3.8
46
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12
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28
29
21
20
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1.8
93
96
0
317
27
29
21
20
1.98
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46
3.8
46
79
12
216
28
29
21
20
1.98
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27
2.4
28
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14
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4
2
34
1.34
596821--596860
20
2.0
20
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0
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0
2
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24
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48
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2.0
20
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603941--604082
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2.3
61
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2
241
4
16
9
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1.31
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0
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0
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0
0
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15
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0
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6
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6
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0
0
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2.0
21
100
0
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13
23
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0
28
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87
37
0
0
62
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2.0
34
100
0
138
37
8
11
42
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
621315--621374
18
3.3
18
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9
77
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25
20
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1.98
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18
2.1
18
100
0
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5
10
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105
2.0
105
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0
355
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1.78
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19
2.4
18
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7
61
45
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2
38
1.56
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15
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20
0
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18
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0
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0
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2.8
132
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1.29
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4.2
12
81
7
55
66
4
4
25
1.27

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410