Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr13 124041150 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  36  of  410  ( 49152 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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114
2.0
114
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0
404
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2.1
30
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3
39
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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53
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9099815--9099862
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28
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1
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10
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17
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66
2
2
28
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
4
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19.3
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3
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1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9201140--9201190
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18
2.8
19
82
8
63
69
1
3
25
1.16
9207955--9208038
16
5.2
16
70
22
59
66
1
2
29
1.11
9208071--9208136
19
3.3
20
80
16
75
59
1
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30
1.38
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18
2.2
19
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9
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76
0
2
20
0.90
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20
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1
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1.14
9213257--9213340
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25
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17
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70
4
1
23
1.14
9213257--9213330
19
4.1
18
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16
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70
5
1
22
1.16
9213306--9213390
16
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16
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1
3
30
1.17
9213318--9213394
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2.3
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63
0
3
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1.12
9213357--9213392
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19
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0
2
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1.08
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15
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1
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27
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27
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0
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1.50
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0
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0
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0
0
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20
89
10
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15
10
18
1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
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0
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0
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26
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21
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0
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0
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0
0
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13
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2.0
201
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0
0
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100
0
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25
0
25
50
1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9290364--9290422
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5
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0
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1.03
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2
20
0
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19
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3
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0
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2.1
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29
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0
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1
2
63
1.13

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410