Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  50  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12868937--12868976
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21
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0
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24
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3.5
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10
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39
0
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29
27
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21
94
0
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30
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1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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3.5
372
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24
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0
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18
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162
47
12
0
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1.48
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114
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297
47
12
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2.0
17
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5
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29
19
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1.60
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2.2
31
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33
18
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1.97
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2.2
128
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518
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33
18
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18
1.96
12968885--12969025
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221
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2.0
52
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6.2
26
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5
24
36
1.79
12977381--12977541
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2.1
78
96
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297
33
5
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26
6.2
26
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1
270
33
5
24
36
1.79
12983243--12983403
77
2.1
78
96
1
297
33
5
24
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1.79
12984885--12984937
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2.0
26
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3
11.3
3
87
6
50
66
0
3
30
1.06
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.5
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28
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30
1.96
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2.5
28
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115
27
14
28
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1.95
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27
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25
1.99
13033441--13033607
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2.1
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83
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205
25
27
21
25
1.99
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40
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89
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47
10
19
21
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13075763--13075788
8
3.2
8
100
0
52
88
0
0
11
0.52
13075762--13075818
5
10.6
5
78
14
51
78
1
0
19
0.83
13075762--13075815
27
2.0
28
85
3
74
79
1
0
18
0.82
13075763--13075849
12
7.6
11
74
14
61
74
1
2
21
0.99
13075825--13075881
3
19.0
3
82
7
71
63
0
1
35
1.05
13075785--13075877
12
7.9
12
71
11
52
66
1
3
29
1.14
13076053--13076151
3
32.7
3
89
4
146
62
0
1
36
1.02
13079908--13079934
2
13.5
2
100
0
54
48
0
0
51
1.00
13082128--13082186
14
4.2
14
75
14
59
54
6
0
38
1.27
13082108--13082181
29
2.5
30
82
4
89
54
8
1
36
1.39
13082128--13082203
29
2.5
29
78
6
80
52
7
0
39
1.31
13087997--13088021
2
12.5
2
100
0
50
48
0
0
52
1.00
13090116--13090291
46
3.8
45
76
12
196
19
19
29
30
1.97
13090112--13090283
93
1.8
93
92
0
290
19
20
30
29
1.97
13097789--13097815
13
2.1
13
100
0
54
14
37
33
14
1.88
13101527--13101583
26
2.2
26
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3
69
26
19
19
35
1.95
13105792--13106020
49
4.6
50
84
2
309
24
17
27
29
1.98
13105795--13106020
100
2.3
98
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2
326
24
18
27
29
1.98
13108541--13108636
42
2.3
42
81
0
102
23
23
29
22
1.99
13115947--13116087
66
2.2
64
84
6
176
22
24
28
24
2.00
13117191--13117226
18
2.0
18
88
0
54
77
0
16
5
0.94
13138625--13138710
43
2.0
43
81
4
102
25
29
19
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13146183--13146468
70
4.1
70
73
2
243
31
24
18
25
1.98
13152403--13152512
44
2.5
44
84
3
139
35
12
22
29
1.91
13152407--13152531
44
2.8
45
81
4
135
34
13
24
28
1.93
13161569--13161614
23
1.9
24
86
8
67
54
10
4
30
1.55
13166930--13166964
14
2.6
13
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4
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48
2
0
48
1.16
13167836--13167862
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1.9
14
100
0
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22
0
37
1.54
13167837--13167871
14
2.5
14
90
0
52
34
25
2
37
1.71
13178370--13178416
18
2.6
18
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23
10
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14
1.74
13184633--13184678
17
2.7
17
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0
83
45
19
0
34
1.51
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1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
13189840--13189947
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
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28
3.5
29
81
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109
28
27
14
29
1.95
13211695--13211744
20
2.5
20
80
3
55
40
20
12
28
1.87
13214511--13214571
24
2.6
23
80
17
63
22
3
4
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1.23
13230542--13230581
18
2.2
18
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0
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12
7
0
80
0.91
13230554--13230581
6
4.7
6
100
0
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14
0
0
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0.59
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25
3.0
25
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7
107
36
18
21
24
1.95
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33
2.0
33
87
0
96
22
27
24
25
2.00
13249210--13249259
24
2.1
23
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10
57
66
12
14
8
1.45
13250300--13250570
27
10.1
27
72
2
195
29
25
18
26
1.98
13253985--13254082
50
2.0
50
97
0
187
25
26
16
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1.96
13255103--13255141
21
1.9
20
84
5
51
43
5
5
46
1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13270142--13270242
29
3.5
29
78
6
107
29
14
27
27
1.96
13278009--13278109
28
3.5
30
82
6
118
29
14
26
28
1.95
13278038--13278113
29
2.7
28
76
13
75
30
14
26
28
1.95
13284843--13285071
27
8.4
27
86
3
280
35
13
24
25
1.93
13284863--13285123
111
2.4
108
80
10
280
34
14
24
26
1.93
13290354--13290396
22
2.0
22
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25
2
0
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0.97
13290352--13290397
14
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15
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2
0
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5.0
24
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154
28
21
20
29
1.98
13321232--13321302
20
3.5
20
86
0
97
32
21
14
32
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410