Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   

This is table  42  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10644117--10644547
150
2.9
148
82
2
537
32
21
16
29
1.95
10656465--10656526
22
2.9
20
68
25
54
50
6
4
38
1.50
10656641--10656732
47
1.9
49
80
8
109
55
4
4
35
1.40
10657190--10657225
19
1.9
18
94
5
63
63
11
2
22
1.39
10657195--10657245
24
2.1
25
89
10
79
60
7
3
27
1.42
10658862--10659147
101
2.8
104
82
4
328
32
16
20
31
1.94
10658805--10659158
104
3.4
103
78
5
349
33
16
19
30
1.94
10659365--10659471
49
2.3
46
81
4
124
42
6
12
39
1.68
10662976--10663032
16
3.5
16
87
2
78
61
3
0
35
1.13
10662988--10663043
16
3.5
16
82
4
69
62
3
0
33
1.12
10663374--10663424
22
2.3
22
82
0
66
11
9
13
64
1.49
10663388--10663436
22
2.2
22
85
0
62
16
16
10
57
1.65
10664757--10664812
29
1.9
29
85
7
78
39
7
17
35
1.78
10666307--10666332
3
8.7
3
100
0
52
30
0
0
69
0.89
10672528--10672563
14
2.6
14
91
8
56
27
0
8
63
1.23
10673630--10673655
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
10676678--10676747
31
2.3
31
85
5
88
48
4
7
40
1.50
10679335--10679364
8
3.6
8
91
8
51
10
0
0
90
0.47
10679334--10679364
9
3.6
9
91
8
55
9
0
0
90
0.46
10679334--10679370
17
2.2
17
90
0
56
16
0
0
83
0.64
10691215--10691252
20
1.9
20
88
0
58
28
0
7
63
1.23
10692105--10692131
14
1.9
14
100
0
54
74
7
0
18
1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10692983--10693021
21
1.9
20
89
5
60
58
7
0
33
1.26
10695510--10695688
76
2.4
76
85
1
234
29
21
24
25
1.99
10698990--10699047
26
2.2
26
93
0
98
36
24
5
34
1.78
10701072--10701235
3
54.7
3
67
18
74
31
6
2
59
1.36
10701074--10701119
23
2.0
23
83
8
58
28
6
0
65
1.17
10701237--10701268
17
1.9
16
93
6
55
34
0
12
53
1.39
10701330--10701403
35
2.1
35
83
14
91
32
5
2
59
1.34
10701467--10701580
22
5.2
23
76
14
100
35
2
2
58
1.26
10701467--10701580
44
2.6
44
78
14
112
35
2
2
58
1.26
10701516--10701578
21
3.0
21
86
6
76
34
4
3
57
1.36
10701584--10701617
16
2.1
17
88
5
52
14
0
32
52
1.42
10703594--10703637
20
2.2
20
88
8
63
50
20
18
11
1.77
10705284--10705326
15
2.9
15
79
6
52
62
4
0
32
1.15
10706383--10706419
18
2.2
16
90
9
56
56
5
0
37
1.22
10707861--10707985
40
3.0
42
81
11
152
28
26
14
30
1.95
10707944--10708063
47
2.6
47
81
4
136
29
26
15
28
1.96
10708072--10708100
7
4.1
7
100
0
58
13
27
13
44
1.82
10708099--10708247
31
4.8
31
90
3
237
26
27
19
26
1.99
10708229--10708351
50
2.4
51
87
5
178
26
23
15
34
1.95
10711709--10711749
22
1.9
21
90
5
64
46
19
14
19
1.84
10713421--10713522
31
3.3
30
75
8
116
36
1
6
54
1.38
10718416--10718445
15
1.9
16
93
6
53
70
3
0
26
1.03
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10718410--10718452
21
2.0
23
90
9
72
69
2
0
27
1.00
10726019--10726043
5
5.0
5
100
0
50
40
0
0
60
0.97
10726525--10726625
50
2.0
50
98
0
193
39
9
10
39
1.74
10726659--10726717
22
2.6
23
84
10
68
62
5
3
28
1.32
10738274--10738372
48
2.1
48
96
0
180
19
20
14
46
1.84
10742626--10742650
13
1.9
13
100
0
50
20
0
8
72
1.10
10742682--10742786
9
12.0
8
78
8
59
28
7
0
62
1.28
10742717--10742783
3
22.3
3
84
0
89
29
7
0
62
1.22
10756428--10756499
3
24.0
3
84
0
90
62
0
6
30
1.21
10757049--10757073
3
8.3
3
100
0
50
68
0
0
32
0.90
10767969--10767997
1
29.0
1
100
0
58
100
0
0
0
0.00
10768827--10768896
27
2.6
27
88
0
104
14
21
0
64
1.29
10770655--10770680
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
10773335--10773475
52
2.7
53
87
4
196
25
17
26
30
1.97
10775961--10776188
46
5.0
46
90
1
296
20
24
14
40
1.90
10778321--10778386
11
6.1
11
72
22
50
63
1
0
34
1.04
10780539--10780575
2
18.5
2
100
0
74
51
0
0
48
1.00
10785480--10785519
17
2.3
18
84
16
57
72
7
10
10
1.28
10786719--10786778
30
2.0
31
90
3
95
45
3
6
45
1.46
10786771--10786826
28
2.0
28
86
6
78
57
1
5
35
1.32
10787074--10787123
22
2.2
22
82
10
57
44
2
0
54
1.11
10788956--10788992
2
18.5
2
100
0
74
48
0
0
51
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10789112--10789154
18
2.4
19
76
11
54
32
0
4
62
1.15
10789162--10789203
14
2.9
14
76
16
50
35
7
0
57
1.26
10796128--10796173
16
2.9
16
83
6
58
41
13
19
26
1.88
10798815--10798872
19
2.9
19
94
5
98
36
17
10
36
1.84
10799218--10800329
44
25.1
45
70
12
347
28
26
15
30
1.96
10799232--10799398
89
1.9
89
89
0
262
26
29
13
29
1.94
10799540--10799631
46
2.0
47
82
6
116
23
21
20
33
1.97
10799675--10800346
176
3.8
176
91
0
1024
28
26
15
29
1.96
10801332--10801392
7
9.0
7
82
10
74
0
14
0
85
0.60
10801332--10801392
8
7.9
8
84
12
67
0
14
0
85
0.60
10801341--10801390
19
2.5
20
90
6
84
0
14
0
86
0.58
10804013--10804047
10
3.5
10
92
0
52
28
11
34
25
1.91
10806576--10806636
19
3.0
21
85
9
63
37
18
9
34
1.83
10806588--10806685
19
5.2
19
91
7
155
35
15
10
38
1.81
10806610--10806666
17
3.5
15
88
11
53
35
15
10
38
1.82
10806588--10806685
36
2.6
37
88
9
144
35
15
10
38
1.81
10806599--10806695
19
5.3
18
87
9
71
37
13
11
38
1.81
10806920--10806976
29
2.0
28
89
3
87
24
17
10
47
1.79
10807247--10807324
20
4.0
20
68
17
56
58
2
5
33
1.33
10807360--10807409
21
2.4
20
81
15
57
38
10
2
50
1.48
10807491--10807550
28
2.1
28
81
0
66
53
3
5
38
1.39
10809425--10809467
18
2.4
19
76
11
54
32
0
4
62
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10815745--10815792
21
2.3
21
96
0
87
18
22
14
43
1.87
10821257--10821294
15
2.5
15
86
0
58
36
5
31
26
1.79
10823643--10823687
11
3.9
11
80
11
54
35
0
2
62
1.08
10833018--10833120
29
3.6
29
81
2
118
21
16
33
29
1.95
10842487--10842616
40
3.2
40
82
4
156
23
29
24
23
1.99
10854368--10854860
88
5.6
88
87
0
675
34
21
21
21
1.97
10854512--10854742
44
5.2
44
63
12
123
33
22
24
19
1.97
10854644--10855057
227
1.8
228
89
2
654
34
20
22
23
1.97
10854556--10855154
315
1.9
316
89
1
943
34
19
22
22
1.96
10854732--10855000
140
1.9
139
85
2
369
35
18
21
24
1.96
10854960--10855101
44
3.2
44
66
15
112
35
17
20
26
1.95
10854871--10855257
88
4.4
87
83
4
418
35
19
22
22
1.96
10856532--10856581
9
5.1
10
83
9
50
14
10
2
74
1.16
10867638--10868197
195
2.9
197
81
5
604
39
21
10
28
1.86
10878814--10879021
54
3.9
54
82
6
224
36
18
24
21
1.95
10878822--10879010
55
3.5
53
81
10
206
35
19
24
20
1.95
10886944--10886993
13
3.6
14
78
13
50
8
26
6
60
1.48
10887421--10887470
3
16.7
3
100
0
100
34
32
0
34
1.58
10887469--10887540
12
6.4
11
74
16
58
27
6
4
61
1.41
10887480--10887556
3
26.3
3
75
5
68
27
5
2
64
1.27
10887587--10887627
15
2.9
14
85
7
55
26
7
0
65
1.18
10887594--10887627
14
2.3
15
90
5
52
26
5
0
67
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10887637--10887690
26
2.1
26
89
6
83
25
5
5
62
1.39
10887711--10887805
41
2.3
42
80
14
115
28
8
1
62
1.31
10893368--10893394
2
13.5
2
100
0
54
51
0
0
48
1.00
10894484--10894508
11
2.3
11
100
0
50
44
0
0
56
0.99
10895613--10895648
7
5.1
7
89
0
54
27
27
5
38
1.79
10895571--10895706
58
2.3
58
91
0
209
27
23
13
35
1.92
10897840--10897893
20
2.7
20
83
11
65
66
0
3
29
1.09
10898023--10898047
13
1.9
13
100
0
50
36
0
0
64
0.94
10898056--10898104
21
2.3
21
82
6
55
28
2
4
65
1.22
10908067--10908115
20
2.5
20
82
0
53
30
4
6
59
1.41

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410