Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  379  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
115336071--115336113
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14
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0
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0
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0
0
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0
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115361071--115361182
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2.1
54
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23
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2.1
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24
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2.0
59
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28
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1.8
93
96
0
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21
29
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
23
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7
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23
14
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11
4.7
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0
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0
0
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29
1.98
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1.8
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272
22
20
28
28
1.98
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18
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16
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0
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2.0
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23
2.0
23
82
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2
8
31
1.44
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2.9
15
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14
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56
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0
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48
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1.82
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3.0
47
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239
29
28
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1.87
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2.9
49
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2
237
29
28
8
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1.87
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2.0
77
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202
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18
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36
3
0
60
1.14
115451214--115451321
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2.4
44
87
3
144
29
23
13
33
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
115457678--115457826
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2.0
30
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2.0
20
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0
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0
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1.56
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24
1.9
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51
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4
34
1.55
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1.9
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82
53
0
0
46
1.00
115466046--115466089
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3.3
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54
0
0
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2.0
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28
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41
3.4
40
89
5
186
32
20
24
22
1.98
Indices
Period
Size
Copy
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Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
1.70
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0
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0
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0
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49
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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3
30
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
3
27
1.03

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410