Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  273  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
29
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1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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G
T
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16
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29
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1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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117
33
3
24
38
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84590742--84590829
21
4.3
21
66
18
60
55
4
1
38
1.28
84599125--84599336
64
3.2
64
62
20
144
30
25
17
25
1.97
84599092--84599378
137
2.1
137
96
0
538
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25
18
24
1.97
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26
3.2
26
96
0
150
36
25
4
33
1.77
84606431--84606488
21
2.9
20
84
5
82
46
6
0
46
1.29
84606435--84606487
20
2.7
19
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8
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5
0
47
1.26
84606313--84606639
172
1.9
172
85
8
461
42
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3
45
1.51
84606455--84606905
153
3.1
147
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7
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1.53
84607256--84607284
3
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100
0
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0
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16
3.2
16
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11
1.72
84611584--84611634
24
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24
85
0
66
52
13
21
11
1.72
84611831--84611945
29
4.0
29
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6
137
27
15
28
27
1.96
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2.2
80
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35
13
22
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1.92
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27
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27
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3
188
35
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23
28
1.92
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281
2.0
281
94
0
992
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16
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1.91
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28
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28
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1.78
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67
2.1
67
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0
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0
0
1.00
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2.5
26
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2
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30
1.9
30
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0
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68
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68
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29
22
1.96
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53
1.9
53
97
0
195
35
8
17
38
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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27
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36
1.80
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37
2.0
37
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0
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1.67
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1.9
30
89
0
89
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1.81
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2.1
17
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2
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1.22
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19
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25
0
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2.0
275
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1.9
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24
1.99
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28
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2.6
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2.00
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25
2.00
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0
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0
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0
0
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0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84702309--84702342
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0
0
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0.79
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1
0
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1.03
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2.4
24
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0
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0
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0
0
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0
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1.8
93
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0
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30
22
20
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410