Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  321  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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27
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0
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35
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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25
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6
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52
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1
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23
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0
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19
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0
2
37
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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(0-2)
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18
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1
46
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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21
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57
53
7
0
39
1.29
100007193--100007281
33
2.7
33
83
0
106
28
26
15
29
1.96
100008519--100008551
17
2.0
17
88
5
50
30
21
0
48
1.50
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51
3.0
44
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15
139
22
16
28
32
1.96
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19
2.5
19
80
12
62
72
6
0
21
1.07
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40
2.3
40
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9
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30
14
26
29
1.95
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72
2.0
72
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212
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5
4
49
1.44
100044282--100044314
17
2.0
17
88
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33
9
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2.5
26
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12
80
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59
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26
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1
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1.37
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128
2.0
128
89
0
387
25
13
22
38
1.91
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45
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31
17
20
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5.7
177
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1
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28
19
22
29
1.98
100059867--100060850
354
2.8
353
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1
1556
29
19
21
29
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128
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39
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33
3.0
33
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2
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53
7
0
40
1.28
100071841--100071922
11
7.4
11
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54
7
0
37
1.28
100072324--100072356
15
2.1
16
88
5
50
57
6
3
33
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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0.90
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0
13
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178
2.0
179
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2.0
133
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28
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1.98
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4.5
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1.95
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2.0
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26
1.94
100111200--100111720
132
4.0
132
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35
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0
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1.01
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19
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2
0
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1.9
21
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10
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27
20
7
45
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
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0
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2.0
30
100
0
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2.1
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0
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3
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0
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0
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0
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0
0
51
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410