Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  7  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.5
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0
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43
13
16
26
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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45
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44
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175
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572
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35
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2.0
20
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4.2
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2.0
25
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26
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6
24
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2.0
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17
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2.0
27
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5
18
25
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
50
35
2
5
55
1.39
2017580--2017637
20
2.8
20
82
7
55
29
6
3
60
1.39
2029839--2030265
86
5.0
86
90
2
556
36
21
22
19
1.95
2029897--2030122
42
5.3
42
69
12
172
33
21
23
21
1.97
2029836--2030265
172
2.5
172
86
3
614
36
21
22
20
1.95
2029938--2030166
44
5.3
44
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15
181
35
21
23
19
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2031841--2031873
2
17.0
2
87
6
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48
3
0
48
1.17
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21
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21
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1.34
2033805--2033846
21
2.0
21
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21
1.47
2036215--2036254
10
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9
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15
55
12
0
0
87
0.54
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16
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16
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8
0
0
91
0.43
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2
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2
100
0
104
50
0
0
50
1.00
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21
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21
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0
70
15
6
0
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0.97
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17
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0
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0.98
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1.42
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0
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23
2.0
24
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8
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1.37
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28
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25
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29
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8
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1.58
2039307--2039424
3
39.3
3
72
16
75
33
7
0
57
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2039638--2039691
3
18.3
3
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17
51
31
5
0
62
1.18
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44
2.4
44
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9
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27
18
26
26
1.98
2045643--2045698
28
2.0
29
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3
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26
0
1
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24
2.5
24
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1
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1.30
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28
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14
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0
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2
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2.2
18
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0
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0
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1.13
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16
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2
0
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23
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21
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7
82
63
1
0
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1.04
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0
0.90
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18
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26
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1.9
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1.72
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17
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0
17
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2.0
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1.70
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46
0
0
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2.0
56
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0
172
39
10
17
31
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2078901--2078945
21
2.1
21
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0
81
8
26
31
33
1.87
2079608--2079786
83
2.1
83
87
5
254
44
20
8
26
1.81
2079608--2079786
43
4.3
43
87
3
251
44
20
8
26
1.81
2081738--2081881
62
2.3
62
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2
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11
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2.1
25
100
0
104
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2081854--2081905
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3.7
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2081793--2081973
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13
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17
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3.3
12
86
6
55
52
17
5
25
1.64

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410