Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  245  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75837918--75837960
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2.7
16
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0
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11
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16
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14
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28
1.95
75841316--75841391
29
2.7
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13
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30
14
26
28
1.95
75849156--75849256
28
3.5
30
82
6
118
29
14
26
28
1.95
75849185--75849260
29
2.7
28
76
13
75
30
14
26
28
1.95
75853339--75853431
40
2.3
40
88
0
132
23
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2.3
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0
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2.3
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5
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20
26
27
1.99
75855392--75855615
79
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244
25
20
26
27
1.99
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5.6
39
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247
24
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79
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26
20
26
26
1.99
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5.6
29
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2
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25
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26
1.96
75865830--75865990
58
2.8
59
85
4
195
25
31
16
27
1.96
75865890--75865990
29
3.5
29
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1
195
26
28
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29
1.95
75873328--75873487
29
5.6
29
87
2
101
25
31
16
26
1.96
75873327--75873487
58
2.8
59
85
4
195
25
31
16
27
1.96
75873387--75873487
29
3.5
29
98
1
195
26
28
14
29
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2.0
32
100
0
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0
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0
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16
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75895818--75895862
19
2.4
18
85
3
54
68
2
11
17
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.3
41
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1
140
26
24
15
32
1.95
75903486--75903668
27
6.8
27
89
1
244
27
16
17
37
1.92
75903486--75903668
54
3.4
54
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3
271
27
16
17
37
1.92
75904050--75904097
23
2.0
24
88
4
71
18
18
16
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1.85
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45
3.7
44
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154
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15
22
1.94
75905161--75905199
14
2.6
16
88
8
55
35
20
2
41
1.66
75907682--75907733
15
3.5
14
82
10
59
59
11
15
13
1.61
75907722--75907751
15
2.0
15
93
0
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1.50
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21
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28
1.98
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10
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3.0
29
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95
10
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3.8
46
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12
225
21
21
28
28
1.98
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1.8
93
96
0
317
20
21
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27
1.98
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2.0
44
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4
140
32
28
18
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1.96
75919974--75920139
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3.7
45
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1.9
16
93
0
53
51
25
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16
1.68
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29
1.9
29
88
0
85
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33
28
1.84
75924892--75924958
29
2.3
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82
7
84
29
14
31
23
1.95
75927133--75927202
27
2.5
28
95
2
124
28
14
27
30
1.95
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2.1
16
100
0
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48
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6
12
1.65
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29
3.7
29
77
6
88
28
14
30
26
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75935010--75935060
22
2.3
22
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66
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5
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43
1.71
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138
2.5
141
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358
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27
19
26
1.99
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91
2.9
90
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268
25
28
19
26
1.99
75949354--75949480
48
2.7
48
80
10
145
29
26
17
26
1.97
75954119--75954271
75
2.0
75
94
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270
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29
19
22
1.98
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40
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27
23
25
2.00
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1.87
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2.6
284
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1.87
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29
1.87
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2.3
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1.97
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29
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28
28
23
20
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75993119--75993204
39
2.2
39
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6
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26
23
18
31
1.97
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78
2.3
81
85
6
248
25
27
22
24
2.00
76009195--76009397
40
5.1
40
83
9
247
25
27
22
24
2.00
76017283--76017504
116
1.9
119
84
9
303
26
27
22
24
2.00
76017264--76017504
40
6.1
40
85
8
284
25
27
21
24
2.00
76022040--76022207
40
4.2
40
81
2
187
25
27
21
25
1.99
76023082--76023109
2
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2
100
0
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0
0
50
1.00
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25
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22
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1.99
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40
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1.96
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75
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27
19
20
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1.97
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16
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2
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23
1.60
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2.6
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0
305
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20
22
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1.98
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21
32
1.98
76034606--76034857
75
3.4
74
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6
283
25
19
23
32
1.97
76036755--76036892
57
2.4
57
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2
161
29
15
19
35
1.92
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18
2.2
18
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58
25
0
15
1.37
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18
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0
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0
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1.85
76040675--76040738
26
2.5
26
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25
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31
1.84
76041149--76041187
14
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14
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0
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0
1
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1.11
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2.6
21
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5
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56
0
0
43
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
0
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0
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0
0
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0
0
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336
26
27
22
23
1.99
76104206--76104423
119
1.8
118
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348
26
27
22
23
1.99
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19
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0
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4.5
40
92
3
283
25
28
23
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76117798--76117857
31
2.0
30
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3
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53
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1.64
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0
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0
0
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0
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2
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24.3
3
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13
87
62
2
0
34
1.10

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410