Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   

This is table  279  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86230388--86230439
26
2.0
26
92
0
86
26
26
11
34
1.91
86230563--86230874
49
6.6
49
73
11
172
24
27
18
28
1.98
86230753--86230877
47
2.7
46
80
9
146
23
28
19
28
1.98
86230520--86230877
142
2.5
142
79
9
363
25
27
19
27
1.99
86234941--86234973
1
33.0
1
100
0
66
100
0
0
0
0.00
86246096--86246271
46
3.8
46
76
12
198
20
19
29
30
1.97
86246092--86246263
93
1.8
93
92
0
290
20
20
30
29
1.97
86248333--86248383
24
2.1
24
96
0
93
52
17
19
9
1.72
86248593--86248678
28
3.0
28
86
3
118
27
13
29
29
1.95
86249526--86249560
18
1.9
18
94
0
61
25
5
2
65
1.28
86252533--86252575
16
2.7
16
81
0
50
58
18
13
9
1.62
86252785--86252870
28
3.0
28
83
3
109
27
13
29
29
1.95
86263409--86263480
35
2.1
35
100
0
144
61
11
8
19
1.54
86264408--86264463
28
2.0
28
100
0
112
35
10
14
39
1.81
86266092--86266141
5
10.0
5
100
0
100
60
0
0
40
0.97
86266404--86266478
21
3.6
20
73
8
78
45
4
20
30
1.69
86266404--86266496
42
2.2
41
96
1
168
46
4
19
30
1.69
86266420--86266493
21
3.5
22
72
9
82
44
5
17
32
1.71
86268652--86268805
84
1.8
84
82
0
200
30
16
25
27
1.97
86276119--86276299
42
4.2
42
71
9
139
29
14
25
29
1.95
86286886--86286911
13
2.0
13
100
0
52
15
30
38
15
1.88
86287046--86287105
29
2.1
29
100
0
120
35
26
21
16
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86293789--86293824
19
2.0
19
89
10
58
55
0
2
41
1.14
86301685--86301746
31
2.0
31
100
0
124
45
0
12
41
1.42
86301934--86301960
2
13.5
2
100
0
54
48
0
0
51
1.00
86304840--86304898
29
2.0
29
100
0
118
40
18
6
33
1.77
86307565--86307736
93
1.8
93
96
0
317
27
30
22
20
1.98
86307557--86307732
46
3.8
46
81
10
232
28
29
21
20
1.98
86314274--86314302
15
1.9
15
100
0
58
41
0
0
58
0.98
86316054--86316094
8
5.1
8
81
0
55
53
19
21
4
1.63
86316341--86316401
26
2.3
27
80
11
72
34
27
9
27
1.89
86318672--86318740
32
2.2
32
100
0
138
39
14
21
24
1.91
86330899--86331061
82
2.0
82
97
0
308
21
17
20
40
1.91
86332197--86332246
11
4.6
10
85
14
64
26
34
0
40
1.56
86332240--86332279
21
1.9
21
85
10
55
22
22
10
45
1.82
86333313--86333343
7
4.4
7
91
0
53
29
0
9
61
1.28
86333960--86334002
18
2.4
18
88
0
59
18
27
9
44
1.80
86337930--86337962
7
4.7
7
85
14
50
45
42
0
12
1.41
86340130--86340164
2
17.5
2
93
0
61
45
0
0
54
0.99
86344762--86345084
44
7.4
44
93
0
531
25
30
15
28
1.96
86345538--86345695
44
3.6
44
73
6
151
17
23
24
35
1.95
86345531--86345759
87
2.6
87
84
1
307
19
22
20
37
1.95
86363340--86363458
60
1.9
64
80
10
140
63
13
7
15
1.51
86366036--86366094
24
2.4
25
80
8
68
42
1
1
54
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86366165--86366196
16
2.0
16
100
0
64
56
0
12
31
1.37
86377046--86377102
27
2.1
27
93
3
78
36
17
21
24
1.94
86377867--86378120
87
2.9
87
85
0
303
27
15
22
34
1.94
86384361--86384514
40
3.8
40
82
5
177
25
27
22
24
2.00
86391514--86391560
25
1.9
25
86
4
69
34
25
14
25
1.94
86391608--86391663
11
5.5
11
71
16
57
35
12
19
32
1.89
86391597--86391663
20
3.3
20
93
0
116
34
11
20
32
1.90
86391713--86391828
23
5.0
24
90
5
168
28
20
21
29
1.98
86391714--86391808
47
2.1
45
94
4
163
28
20
21
30
1.98
86392021--86392084
31
2.1
31
93
0
110
37
15
23
23
1.93
86399593--86399640
25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
86399688--86399743
11
5.5
11
71
16
57
35
12
19
32
1.89
86399677--86399743
20
3.3
20
93
0
116
34
11
20
32
1.90
86399793--86399864
24
3.0
24
85
6
92
27
22
22
27
1.99
86400058--86400121
31
2.1
31
93
0
110
37
15
23
23
1.93
86403719--86403810
36
2.5
37
80
16
109
29
38
13
19
1.89
86407336--86407416
4
19.8
4
74
5
63
6
24
3
65
1.32
86407945--86408008
20
3.2
20
77
14
71
32
6
15
45
1.71
86408609--86408725
61
2.0
60
89
5
184
52
5
2
40
1.37
86408667--86408774
48
2.2
51
85
6
141
52
5
3
37
1.42
86409048--86409083
19
1.9
19
94
5
65
16
5
27
50
1.68
86409221--86409259
14
2.8
13
85
11
51
38
10
2
48
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86410022--86410079
23
2.5
23
100
0
116
43
8
12
36
1.73
86417108--86417144
19
1.9
19
88
0
56
75
2
2
18
1.04
86425153--86425195
16
2.5
17
85
14
61
58
0
2
39
1.11
86425972--86426022
27
2.0
27
88
7
79
56
1
1
39
1.22
86432412--86432521
42
2.6
42
82
4
132
32
24
17
25
1.96
86432412--86432568
43
3.7
41
80
8
154
33
25
15
24
1.95
86432933--86432965
8
4.1
8
96
0
57
27
21
0
51
1.48
86437295--86437340
2
23.0
2
95
0
83
52
0
47
0
1.00
86444406--86444455
9
5.6
9
85
0
73
46
20
8
26
1.78
86444474--86444514
6
6.5
6
83
10
55
17
0
4
78
0.93
86445558--86445882
48
6.8
48
83
6
367
24
29
19
27
1.98
86457609--86457649
6
6.8
6
100
0
82
0
51
14
34
1.43
86459246--86459275
7
4.3
7
91
0
51
0
13
0
86
0.57
86460888--86460921
16
2.0
17
88
11
52
29
5
17
47
1.71
86462534--86462869
48
7.0
48
74
5
275
26
17
28
27
1.98
86462533--86462869
96
3.5
97
81
6
353
26
17
28
27
1.98
86464949--86464987
20
2.0
20
84
0
51
58
2
2
35
1.25
86466704--86467121
83
5.0
83
96
0
755
27
19
20
32
1.97
86467076--86467296
119
1.9
119
88
1
336
30
19
16
33
1.94
86485632--86485678
14
3.3
14
77
14
51
10
2
8
78
1.04
86485851--86486216
44
8.0
44
75
11
191
28
20
18
31
1.97
86486078--86486173
51
1.9
50
86
2
138
29
18
18
33
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86486037--86486214
95
1.9
94
85
1
248
29
20
17
32
1.96
86489945--86490154
40
5.2
40
87
2
305
25
24
28
21
1.99
86498084--86498293
40
5.2
40
87
2
305
25
24
28
21
1.99
86503668--86504065
38
8.8
47
73
15
188
23
32
19
25
1.98
86503670--86503849
49
3.7
48
81
9
145
25
30
20
24
1.98
86503668--86503846
96
1.8
96
84
8
245
24
30
20
24
1.98
86503668--86503975
46
6.5
48
75
11
228
24
30
19
25
1.98
86503939--86504054
38
3.1
38
97
0
214
19
36
18
25
1.95
86506067--86506112
3
15.3
3
100
0
92
67
0
0
32
0.91
86506162--86506195
12
3.0
11
87
8
50
70
0
5
23
1.09
86507577--86507623
14
3.3
14
75
24
53
8
0
12
78
0.95
86509946--86509989
3
14.3
3
95
4
79
34
0
0
65
0.93
86513605--86513808
94
2.2
94
90
0
318
31
20
11
36
1.88
86530486--86530532
19
2.3
20
82
10
60
48
0
12
38
1.41
86531580--86531681
14
7.1
14
69
18
57
25
10
0
62
1.34
86531580--86531650
29
2.5
28
75
22
67
25
8
1
64
1.30
86531812--86531976
3
55.7
3
75
12
119
29
5
2
62
1.30
86531888--86531991
49
2.1
50
79
12
117
28
4
3
62
1.33
86533575--86533603
13
2.2
13
100
0
58
17
31
34
17
1.93
86539070--86539098
11
2.6
11
100
0
58
93
0
6
0
0.36
86541115--86541169
26
2.1
26
96
0
101
23
14
29
32
1.94
86542980--86543049
27
2.5
28
88
2
106
31
25
14
28
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86550900--86550969
27
2.5
28
88
2
106
31
25
14
28
1.95
86554417--86554460
23
1.9
23
81
9
54
20
18
6
54
1.66
86556852--86557036
41
4.6
41
82
4
216
27
27
21
24
1.99
86556851--86557050
81
2.5
81
82
6
244
27
27
21
24
1.99
86563978--86564177
81
2.5
81
83
6
262
26
28
22
23
1.99
86563979--86564163
41
4.6
41
85
4
234
26
27
22
23
1.99
86566863--86567029
40
4.2
40
82
2
185
25
27
21
25
1.99
86566863--86567029
80
2.1
79
83
7
205
25
27
21
25
1.99
86567855--86567900
17
2.5
19
74
22
53
34
23
17
23
1.96
86574870--86575036
40
4.2
40
82
2
185
25
27
21
25
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410