Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
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This is table  386  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
117143926--117143956
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2.1
15
100
0
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0
19
1.49
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2.0
70
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0
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37
1.81
117148947--117148989
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18
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3
52
2
18
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1.00
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3.5
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3.0
32
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0
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31
6
23
38
1.80
117154413--117154465
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2.0
26
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15
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2.0
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100
0
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11
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24
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12
100
0
50
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0
8
64
1.22
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20
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28
0
14
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102
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0
14
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1.41
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4.1
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425
25
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470
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1.64
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21
2.0
21
90
0
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1.91
117171546--117171585
7
5.7
7
81
0
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32
32
12
22
1.91
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3.0
20
75
11
54
19
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35
41
1.67
117174630--117174690
30
2.1
31
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9
83
44
0
1
54
1.10
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1.9
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2
108
47
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4
39
1.53
117175147--117175229
36
2.3
35
81
6
94
48
7
6
38
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3
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9
10.0
9
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14
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56
0
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2
1.12
117176878--117176940
3
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3
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9
51
63
0
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3
1.10
117176892--117176942
25
2.1
25
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3
59
62
0
33
3
1.13
117176885--117176943
17
3.5
17
81
6
66
62
0
33
3
1.12
117176878--117176943
17
4.0
17
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15
59
62
0
34
3
1.11
117177435--117177496
15
4.0
15
76
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61
67
4
6
20
1.32
117177599--117177661
15
4.1
16
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4
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1.28
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1.53
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0
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0
0
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0.90
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1.04
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2
32
1.07
117177900--117177957
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1.31
117178035--117178100
30
2.2
31
88
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98
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6
22
1.26
117178177--117178238
13
4.5
13
73
11
52
67
3
3
25
1.20
117177513--117178531
438
2.3
438
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5
1405
55
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7
30
1.53
117180404--117180548
72
2.0
72
90
2
229
22
28
17
32
1.96
117185939--117186000
16
3.5
17
78
12
54
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29
0
69
0.98
117185947--117186020
30
2.6
28
74
24
75
2
27
0
70
1.01
117186109--117186152
18
2.4
19
84
3
54
9
11
6
72
1.27
117186219--117186276
23
2.2
25
82
17
66
18
1
12
67
1.31
117189731--117189775
21
2.1
21
87
4
63
51
13
11
24
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
117192186--117192220
17
2.1
17
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0
61
51
34
14
0
1.42
117195348--117195396
20
2.4
20
82
3
62
67
4
2
26
1.19
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100
0
84
33
0
0
66
0.92
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22
2.0
22
86
8
63
27
9
2
60
1.40
117198077--117198116
4
9.5
4
84
10
53
20
5
2
72
1.15
117198077--117198116
9
4.8
8
90
3
53
20
5
2
72
1.15
117214017--117214602
44
13.5
44
70
7
223
19
22
21
36
1.95
117214011--117214611
86
7.0
86
76
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441
19
22
21
36
1.95
117214267--117214611
130
2.7
129
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358
19
23
21
35
1.96
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2.8
32
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144
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5
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1.09
117229056--117229146
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148
76
14
5
3
1.08
117229056--117229150
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17
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14
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75
14
5
4
1.13
117229056--117229146
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2.8
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90
8
130
76
14
5
3
1.08
117229183--117229209
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2.5
11
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0
54
11
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25
6
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0
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57
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20
19
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1
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32
1.97
117237529--117237690
74
2.1
75
87
6
229
29
19
20
30
1.97
Indices
Period
Size
Copy
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Consensus
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Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
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(0-2)
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19
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76
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19
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1.94
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6.7
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77
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29
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19
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27
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2.1
29
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14
11
25
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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60
1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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7
517
33
22
16
28
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410