Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  392  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
118998895--118998929
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18
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2
0
54
1.15
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0
1
63
1.05
119008714--119008799
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0
1
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2.1
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0
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2.0
40
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13
15
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22
22
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33
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234
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18
22
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11.1
15
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11
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27
18
22
31
1.97
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6.3
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2
380
25
22
22
28
1.99
119024968--119025368
30
13.1
30
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354
25
22
23
28
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0
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50
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2.2
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0
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0
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2.4
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5
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12
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2.1
24
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1.9
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7
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5.0
5
100
0
50
0
0
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80
0.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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15
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0
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2
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0
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2.0
34
100
0
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2
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2
100
0
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0
0
50
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36
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0
60
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64
38
2
0
60
1.09
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17
2.0
17
88
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50
42
3
0
54
1.15
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28
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1
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30
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24
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66
3
0
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1.07
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70
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6
0
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119125453--119125526
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3.4
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16
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64
0
1
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3.8
46
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205
29
29
20
20
1.98
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93
1.8
93
94
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308
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29
20
20
1.98
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3.8
177
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950
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21
18
30
1.97
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3.6
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4
175
34
20
22
23
1.97
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21
2.0
20
82
13
50
25
2
27
44
1.66
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32
2.8
32
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80
21
0
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1.53
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20
0
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30
1.49
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42
2.1
42
87
6
126
37
15
21
25
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
119151818--119151865
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2.3
21
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22
14
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1.54
119152162--119152361
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4.7
43
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4
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26
20
23
30
1.98
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1.9
85
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0
267
26
20
22
30
1.98
119152362--119152426
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2.4
27
100
0
130
12
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30
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1.88
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211
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15
18
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1.91
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2.0
146
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532
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12
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119169591--119169644
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2.0
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1
1
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0
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25
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23
88
7
71
29
10
4
55
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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0
0
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18
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66
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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21
29
19
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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8
172
31
10
24
33
1.90

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410