Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  275  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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32
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1
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71
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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26
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20.5
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19
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4.9
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307
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17
26
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12
72
10
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5
16
0
78
0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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1.30
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19
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19
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22
27
24
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85180692--85180953
40
6.6
40
85
6
264
24
20
28
26
1.99
85184743--85184980
49
4.9
49
92
2
399
33
9
27
28
1.89
85184743--85184980
96
2.5
97
92
1
397
33
9
27
28
1.89
85184972--85185123
48
3.2
48
97
0
286
34
5
27
32
1.81
85185163--85185253
37
2.4
37
94
1
155
23
19
32
24
1.97
85196102--85196141
21
1.9
21
90
10
64
70
0
2
27
1.01
85196123--85196179
18
3.2
17
79
18
62
66
1
0
31
1.02
85196932--85197009
27
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2
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1.26
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2.0
22
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0
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1.15
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0
39
1.50
85202777--85202848
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16
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1
101
27
25
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20
2.2
20
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0
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1.54
85209992--85210066
31
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44
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14
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1.84
85214840--85214922
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14
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50
1.49
85227090--85227167
33
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12
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28
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1.30
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21
2.0
21
100
0
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0
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19
2.9
18
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38
1
0
59
1.08
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17
1.9
18
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5
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38
5
5
50
1.51
85255226--85255282
15
3.9
15
88
2
89
35
0
12
52
1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85255666--85255747
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3.8
21
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3
110
15
23
26
34
1.95
85255656--85255761
42
2.5
42
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131
16
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1.95
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54
2.0
54
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0
218
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11
25
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18
2.1
18
100
0
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5
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2
0
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0
1
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21
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0
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12
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0
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2.0
22
100
0
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13
22
1.77
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21
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56
1
0
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1.10
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15
2.3
15
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65
2
0
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1.07
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2.3
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1
0
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2.7
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0
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30
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26
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0
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39
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0
204
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0
180
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237
17
24
24
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85283409--85283567
27
5.9
27
83
11
193
18
24
22
34
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85288813--85288920
26
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37
1.80
85290543--85290683
54
2.6
53
94
2
237
17
24
24
34
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85290543--85290701
27
5.9
27
83
11
193
18
24
22
34
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85295845--85295952
26
4.2
26
93
0
189
32
7
24
36
1.83
85297375--85297450
26
2.8
26
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13
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1.91
85297554--85297694
54
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53
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2
237
17
24
24
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1.95
85297554--85297712
27
5.9
27
83
11
193
18
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1.96
85305910--85306175
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1.98
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289
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22
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1.48
85317370--85317500
29
4.5
29
88
0
163
29
15
31
23
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410