Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  32  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
22
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28
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8090261--8090387
22
5.3
23
75
16
89
55
4
4
34
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4.0
22
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2
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21
2.1
18
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53
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2
5
30
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8090328--8090449
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19
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18
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2
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3.2
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20
17
1.92
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4.4
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195
39
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20
17
1.92
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0
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21
3.9
21
75
11
89
28
1
25
44
1.61
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46
2.0
46
97
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171
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2
25
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7
10.3
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21
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26
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1
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23
6
34
1.80
8106031--8106192
78
2.1
78
94
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279
35
23
6
34
1.80
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2.1
15
100
0
62
6
29
12
51
1.65
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4.2
12
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34
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23
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30
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23
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20.5
2
100
0
82
0
0
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51
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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8108972--8109315
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325
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22
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1.80
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365
33
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22
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3
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1.41
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0
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25
20
31
22
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8131263--8131474
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26
20
31
21
1.98
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4.5
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11
171
25
20
30
23
1.98
8131314--8131480
90
1.8
91
84
5
221
25
20
31
22
1.98
8137089--8137154
19
3.2
21
87
6
64
36
19
9
34
1.84
8137106--8137203
19
5.2
19
90
7
155
34
16
11
37
1.84
8137106--8137213
36
2.9
35
75
20
103
35
15
11
37
1.83
8137644--8138136
176
2.8
174
87
3
707
27
20
19
32
1.97
8137605--8138108
87
5.8
88
68
14
308
27
20
19
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1.97
8138280--8139961
84
20.1
84
88
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2464
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22
22
29
1.99
8138534--8139927
41
33.4
42
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27
170
25
22
22
29
1.99
8138280--8139961
751
2.2
745
91
2
2712
25
22
22
29
1.99
8140458--8140507
16
3.1
16
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8
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36
16
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1.58
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46
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22
23
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2.3
30
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5
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29
17
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47
1.71
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1
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1
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0
57
1
11
0
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2.1
24
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11
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4
16
0
79
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8144481--8144545
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0
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0.65
8144477--8144545
21
3.4
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1
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0
86
0.62
8144479--8144545
30
2.3
28
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5
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11
0
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19
3.2
21
87
6
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36
19
9
34
1.84
8150189--8150267
19
4.2
19
90
9
126
35
16
10
37
1.82
8150211--8150267
17
3.5
15
88
11
53
35
15
10
38
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8150189--8150267
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2.1
39
90
9
128
35
16
10
37
1.82
8150711--8151214
176
2.8
174
85
5
672
27
19
18
34
1.95
8150760--8151273
176
2.9
174
83
5
450
27
20
17
34
1.95
8151346--8153529
84
26.1
84
87
4
3057
25
21
22
30
1.99
8151346--8153529
334
6.5
332
88
4
2969
25
21
22
30
1.99
8151346--8153529
500
4.4
497
89
4
3044
25
21
22
30
1.99
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17
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1.47
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23
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21
3.0
20
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6
63
22
12
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33
1.91
8160994--8161087
42
2.2
42
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3
118
23
12
31
31
1.92
8166106--8166241
26
5.2
26
94
0
236
36
25
5
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1.78
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1.80
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2.1
76
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1.83
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130
40
19
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1.81
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11
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0
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1.63
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2.0
33
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0
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2
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26
2.1
25
89
3
79
49
1
3
45
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8184889--8184932
22
2.0
22
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2.0
44
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0
102
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21
20
1.94
8193147--8193194
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2.0
25
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12
10
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2.3
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20
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10
0
25
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0
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2.1
137
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0
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26
6.2
26
92
0
257
36
23
6
33
1.81

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410