Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  331  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102712372--102712480
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1
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1.17
102712780--102712866
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3.4
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102712781--102712870
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0
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2
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2.8
62
78
9
196
59
11
7
20
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
21
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0
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2
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0
21
1.52
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2.2
20
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20
4
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1.31
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14
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14
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0
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43
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40
0
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1.50
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2
29
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22
2.2
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0
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0
19
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1.46
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23
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1.9
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0
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23
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5
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32
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5
2
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82
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2.1
37
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10
3.7
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88
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0
0
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0.78
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0
0
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64
4
0
31
1.14
102766035--102766118
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7.5
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20
51
65
3
0
30
1.10
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1
0
43
1.11
102766181--102766238
14
3.9
14
72
24
55
56
1
1
39
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.0
33
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2
40
1.22
102766218--102766296
20
4.1
20
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53
56
1
1
40
1.15
102766250--102766309
22
2.5
24
77
17
72
53
5
0
41
1.23
102766334--102766373
4
10.2
4
89
10
57
77
0
0
22
0.77
102766326--102766366
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2.8
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0
0
24
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19
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2
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0.97
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2.6
23
75
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1
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26
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5
68
39
21
9
29
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102824995--102825056
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5
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25
12
29
1.93
102825161--102825301
27
5.2
26
83
6
174
17
24
23
34
1.96
102825161--102825301
54
2.6
53
90
2
219
17
24
23
34
1.96
102840975--102841024
25
2.0
26
88
4
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32
16
0
52
1.44
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28
2.7
26
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16
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41
1
0
57
1.08
102841958--102842052
10
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10
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37
2
1
58
1.17
102842124--102842162
17
2.3
17
86
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23
2
5
69
1.21
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26
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0
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14
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0
1
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0
1
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1.05
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102848056--102848233
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5.0
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258
36
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11
37
1.82
102848056--102848233
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11
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1.82
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119
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17
16
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1.93
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358
2.1
362
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3
1230
31
17
16
33
1.93
102848840--102849676
358
2.3
359
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5
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31
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16
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1.94
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3.2
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0
0
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0
1
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0
1
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1.02
102857097--102857187
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4.9
19
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134
36
14
10
38
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102857097--102857182
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25
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2
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20.9
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0
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2.6
15
83
4
51
71
2
7
18
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
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23
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0
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2.0
26
82
10
63
36
23
15
25
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410