Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  14  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
214
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2
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1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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28
21
21
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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93
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2.0
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1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
3797183--3797239
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26
0
3
70
1.03
3799417--3799464
17
2.8
18
81
6
55
31
31
16
20
1.95
3799494--3799528
18
1.9
18
100
0
70
54
17
5
22
1.64
3809498--3809523
8
3.2
8
100
0
52
50
0
0
50
1.00
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19
1.9
17
88
11
52
34
0
28
37
1.58
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29
2.0
29
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24
0
29
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1.53
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30
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28
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7
76
12
30
3
53
1.55
3817783--3817823
12
3.3
13
84
15
52
19
4
7
68
1.32
3817849--3817879
15
2.1
15
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0
53
25
25
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1.96
3824633--3824672
2
20.0
2
100
0
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50
0
0
50
1.00
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19
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20
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56
60
2
2
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1.22
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3
14.0
3
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0
57
30
0
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20
2.3
20
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0
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12
10
0
76
1.02
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13
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12
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0
1
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0
1
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4.0
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214
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0
1
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3833413--3833526
20
6.2
20
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25
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39
0
1
58
1.08
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9
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11
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0
0
57
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17
4.0
17
78
9
70
52
1
1
44
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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13
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0
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0
0
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24
2.3
24
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55
3
0
41
1.17
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21
3.2
21
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8
82
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0
0
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0.99
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21
4.5
20
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19
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57
1
0
41
1.06
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9
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2
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1.05
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2.1
14
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0
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0
13
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0.77
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0
12
6
0.86
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3.7
126
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520
38
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28
1.90
3840123--3840592
256
1.8
253
83
4
624
38
18
14
28
1.90
3841175--3841212
2
19.5
2
94
5
69
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0
0
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1.00
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4
4
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0.97
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150
28
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2
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1.34
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14
2.2
14
100
0
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25
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19
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1.95
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19
3.6
19
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18
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39
2
5
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1.41
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19
4.1
18
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2
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52
1.41
3852453--3852529
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2.0
39
97
0
145
38
2
6
51
1.41
3852991--3853053
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2.2
29
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5
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2.2
23
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10
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44
6
10
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21
21.4
21
81
7
420
20
61
5
11
1.50
3855838--3856296
153
3.1
153
85
5
580
20
61
5
11
1.50
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19
2.4
19
85
10
65
31
20
0
48
1.49
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21
2.7
21
80
0
67
28
57
5
8
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3860273--3860661
63
6.2
63
94
0
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53
7
14
1.67
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62
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63
79
4
277
15
60
7
16
1.56
3860651--3860952
21
14.5
21
79
4
238
16
60
7
15
1.55
3861949--3862396
190
2.4
191
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7
570
43
5
9
41
1.62
3863774--3863828
26
2.1
26
90
6
85
16
23
21
38
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3863782--3863888
24
4.3
24
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4
79
17
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23
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3866302--3866595
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2.0
145
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0
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24
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19
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3
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1.38
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22
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1.93
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30
1.9
30
82
3
73
49
1
22
27
1.59

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410