Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  297  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.98
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24
26
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
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T
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2.0
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36
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
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Indices
Period
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A
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(0-2)
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46
2.3
46
85
4
133
26
30
16
26
1.97
91965466--91965490
13
1.9
13
100
0
50
80
0
0
20
0.72
91966940--91966973
11
3.1
11
100
0
68
35
17
35
11
1.87
91973174--91973214
13
3.5
13
75
25
54
41
0
4
53
1.22
91973174--91973217
22
2.0
22
100
0
88
40
0
4
54
1.21
91990104--91990128
12
2.1
12
100
0
50
56
8
0
36
1.29
91991094--91991132
14
2.8
14
88
0
51
46
33
5
15
1.68
91991720--91991769
26
2.0
26
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22
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91996665--91996977
47
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47
77
10
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23
30
19
26
1.98
91996665--91996977
93
3.3
92
84
5
371
23
30
19
26
1.98
91996668--91996931
140
1.9
140
80
10
315
23
30
19
27
1.98
91997949--91998001
26
2.0
27
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3
90
16
28
3
50
1.62
92003341--92003390
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2.5
20
90
0
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20
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1.81
92004339--92004385
24
2.0
23
84
12
60
36
19
25
19
1.95
92017753--92017982
47
4.9
47
77
12
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23
28
18
28
1.98
92017753--92018027
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2.9
93
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340
24
28
18
28
1.98
92021339--92021415
26
3.0
26
84
0
100
40
19
19
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1.92
92025510--92025572
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2.0
31
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0
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25
9
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1.75
92030190--92030260
28
2.5
28
74
17
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45
0
8
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1.33
92035355--92035541
26
7.2
26
96
0
304
34
5
24
36
1.78
92041223--92041379
74
2.1
76
90
5
248
34
5
23
36
1.77
92041223--92041379
25
6.2
25
93
6
239
34
5
23
36
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92047110--92047195
25
3.5
25
93
6
142
31
5
25
37
1.80
92052729--92052777
20
2.3
20
83
13
55
61
0
4
34
1.15
92052729--92052777
23
2.2
22
85
10
64
61
0
4
34
1.15
92062133--92062167
13
2.6
14
90
4
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37
28
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28
1.80
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20
2.7
20
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0
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24
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37
1.79
92062289--92062326
14
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15
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13
5
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1.63
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2.0
27
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1.95
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3.3
91
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1.98
92070566--92070876
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23
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1.98
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26
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26
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56
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27
29
16
26
1.97
92074329--92074427
28
3.5
28
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25
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1.98
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8
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25
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30
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0
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26
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28
3.1
28
73
19
79
41
22
5
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0
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0
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7
3.6
7
100
0
50
28
28
0
44
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92110747--92110798
26
2.0
26
100
0
104
34
15
3
46
1.64
92111504--92111555
14
3.4
15
77
17
54
30
3
0
65
1.10
92113037--92113090
23
2.4
22
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0
5
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1.19
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1.9
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100
0
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0
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1.47
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2.2
18
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18
0
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44
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1
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28
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1
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0
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0
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2.2
18
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4
60
18
0
7
73
1.06

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410