Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  10  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2606909--2606948
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2
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22
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1.93
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2.1
20
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12
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2.0
24
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30
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5
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31
2.3
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129
4
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1.20
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30
1.9
30
89
6
91
44
25
8
20
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2644145--2644740
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7.7
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33
20
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2644184--2644718
74
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13
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33
19
17
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1.95
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244
3.3
244
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19
16
28
1.94
2644394--2644740
74
4.7
74
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441
32
21
17
28
1.96
2644394--2644740
149
2.3
147
85
3
446
32
21
17
28
1.96
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49
2.0
49
95
0
174
33
19
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30
1.94
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121
2.0
121
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34
17
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1.9
72
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15
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3.0
201
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18
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2.0
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201
31
19
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54
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1.89
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2.0
124
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22
12
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2.5
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13
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41
2.0
39
92
4
133
23
18
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3.1
31
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111
40
2
2
55
1.23
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2.1
16
88
5
50
36
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3
60
1.12
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31
2.3
27
80
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78
35
10
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2.0
31
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33
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25
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1.88
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16
4.4
16
79
0
68
31
24
4
40
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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18
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24
1.96
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1.8
148
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17
23
24
1.96
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2.1
30
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2.5
16
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27
25
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35
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0
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2
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0
0
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17
2.3
19
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16
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52
0
0
47
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2682486--2682521
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0
0
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0
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0
0
39
0.97
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17
3.0
18
81
10
65
56
0
3
39
1.17
2682707--2682765
26
2.3
27
82
8
77
59
0
0
40
0.97
2682725--2682761
17
2.2
16
90
4
56
62
0
0
37
0.96
2682589--2682866
127
2.1
130
88
9
415
51
2
4
41
1.38
2682707--2682765
9
6.8
9
75
13
52
59
0
0
40
0.97
2683316--2683456
40
3.6
39
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11
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32
2
2
62
1.22
2683345--2683761
9
43.8
9
66
18
93
33
1
3
61
1.22
2683415--2683458
19
2.2
21
92
8
74
29
0
2
68
1.02
2683424--2683467
21
2.2
19
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27
0
4
68
1.09
2683423--2683487
33
1.9
34
87
9
98
29
0
4
66
1.12
2683485--2683587
21
5.0
20
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21
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31
1
3
63
1.24
2683544--2683587
20
2.2
20
83
0
52
31
0
2
65
1.05
2683614--2683761
19
8.4
17
69
23
69
34
0
4
60
1.20
2683706--2683753
21
2.3
22
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10
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35
0
4
60
1.16
2685644--2685795
43
3.5
44
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7
168
23
19
20
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1.95
2685644--2685770
45
2.9
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148
23
21
18
36
1.95
2685607--2685770
88
1.9
89
84
3
224
25
21
19
34
1.96
2687154--2687252
10
10.2
10
72
16
75
64
0
3
32
1.09
2687154--2687253
9
10.4
9
75
15
85
64
0
3
33
1.09
2687154--2687253
19
5.2
19
70
20
50
64
0
3
33
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2687152--2687261
58
1.9
58
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14
138
63
0
3
31
1.18
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21
2.2
21
84
7
58
54
8
4
32
1.51
2687516--2687553
17
2.2
18
85
4
51
15
2
5
76
1.08
2688018--2688115
43
2.3
43
90
0
151
23
30
26
19
1.98
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20
2.2
20
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0
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0
6
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1.24
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9
21.0
9
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21
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32
1
5
60
1.28
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2.8
24
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15
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33
0
2
63
1.09
2691584--2691721
8
16.1
8
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15
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31
0
2
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1.13
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19
3.2
18
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24
1
5
68
1.19
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14
2.4
15
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8
11
0
0.90
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17
2.5
17
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80
0
0
19
0.70
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2.4
14
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0
50
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29
1.79
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2
22.5
2
91
8
74
48
0
2
48
1.13
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31
1.9
31
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77
40
1
20
38
1.62
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23
2.0
23
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20
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18
1.9
18
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0
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5
0
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14
2.0
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10
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1.66
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26
4.2
26
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2
177
33
6
24
35
1.81
2730194--2730333
27
5.2
27
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2
165
18
25
22
34
1.96
2730194--2730333
54
2.6
55
86
2
185
18
25
22
34
1.96
2734123--2734273
53
2.8
53
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214
25
16
27
29
1.97
2736990--2737056
26
2.6
25
88
9
98
32
4
26
35
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2737950--2737999
9
5.9
9
75
13
52
64
0
4
32
1.12
2737940--2738000
17
3.6
17
80
6
70
65
0
3
31
1.09
2737951--2738000
16
3.1
16
78
16
66
64
0
4
32
1.12
2738093--2738125
16
2.1
16
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5
59
27
0
3
69
1.03
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24
2.2
24
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12
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3
0
34
1.13
2738248--2738291
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0
0
31
0.90
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0
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2.0
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0
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27
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18
1.98
2742926--2742970
14
3.1
14
76
17
56
26
31
26
15
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410