Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
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This is table  363  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111605373--111605430
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29
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3
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6
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111609507--111609540
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1.9
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2.2
24
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0
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3
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22
2.2
23
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3
66
62
0
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2.6
17
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13
56
46
2
2
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111622988--111623030
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2.0
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0
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2
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1
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1
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1.50
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16
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34
0
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2.9
22
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0
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2.2
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0
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31
0
0
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28
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3
100
0
64
34
0
0
65
0.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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35
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2.9
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25
26
22
25
2.00
111693619--111693716
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4.0
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27
24
22
25
2.00
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28
2.0
29
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3
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0
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0
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38
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0
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0
0
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32
5
0
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32
0
1
65
1.01
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5.1
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75
21
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30
11
1
56
1.44
111730443--111730485
16
2.6
16
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17
52
30
11
2
55
1.48
111730427--111730495
12
5.7
11
75
21
50
31
11
1
55
1.45
111730438--111730512
28
2.8
28
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18
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32
10
1
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2.0
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0
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21
12
33
1.90
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43
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282
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21
21
1.97
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3.0
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640
35
21
21
21
1.96
111737254--111737646
87
4.5
87
70
14
297
35
21
21
22
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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45
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12
259
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18
23
27
1.98
111737649--111738043
44
8.7
44
72
9
249
29
18
23
27
1.98
111739811--111739907
6
15.3
7
82
8
63
32
6
0
60
1.21
111739843--111739914
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24.0
3
91
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119
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0
1
66
1.00
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27.0
3
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9
1
57
1.38
111740078--111740149
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4.8
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80
16
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9
1
58
1.39
111740066--111740142
30
2.7
27
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77
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10
1
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1.41
111740097--111740159
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4.4
14
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31
9
0
58
1.30
111740096--111740159
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2.9
23
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25
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9
0
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2
46
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15
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0
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37
1.23
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1.77
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17
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1.72
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19
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16
10
36
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141
35
17
9
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1.83
111754956--111755035
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2.2
37
88
6
110
38
13
12
35
1.83
111755459--111755623
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1.9
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81
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199
26
22
18
32
1.97
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261
2.0
257
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17
33
1.96
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205
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21
17
31
1.96
111757362--111757426
7
8.7
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76
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37
1.83
Indices
Period
Size
Copy
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1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Score
A
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0
25
1.52

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410