Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  360  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
110902025--110902081
11
5.5
11
76
16
59
33
8
21
36
1.84
110902015--110902081
20
3.3
20
87
0
89
32
8
22
35
1.85
110902130--110902250
24
5.0
24
86
7
165
30
20
20
28
1.98
110902130--110902268
49
2.8
49
81
11
169
31
20
20
27
1.97
110902444--110902506
31
2.1
31
87
3
92
38
17
22
22
1.93
110910108--110910174
20
3.3
20
85
0
89
31
10
23
34
1.89
110910223--110910343
24
5.0
24
90
7
183
28
20
22
28
1.99
110910223--110910352
49
2.6
48
86
9
183
30
19
22
27
1.98
110910537--110910600
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2.1
31
93
0
110
37
15
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23
1.93
110911397--110911430
17
1.9
18
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5
52
14
11
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70
1.27
110911786--110911842
28
2.0
29
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3
107
42
7
7
43
1.58
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18
2.2
19
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4
64
72
0
2
25
0.97
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50
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0
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0.90
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4.1
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66
11
1
1
84
0.79
110950618--110950660
20
2.2
19
87
4
59
20
2
2
74
1.04
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79
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62
68
0
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27
1.09
110951699--110951764
20
3.2
20
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2
78
68
0
4
27
1.09
110952133--110952222
30
2.9
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112
40
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5
51
1.42
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5.9
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80
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54
32
0
0
67
0.91
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10
5.5
10
81
14
62
37
3
0
58
1.15
110952545--110952609
18
3.2
20
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14
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36
3
0
60
1.13
110952836--110952924
9
9.9
9
71
12
58
28
2
1
68
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
110952836--110952922
18
4.8
18
69
18
65
27
2
1
68
1.08
110952846--110952870
12
2.1
12
100
0
50
24
0
0
76
0.80
110952900--110952944
19
2.4
19
88
7
65
33
4
2
60
1.29
110956215--110956277
23
2.6
25
75
12
69
55
1
6
36
1.35
110963040--110963114
33
2.3
33
81
4
80
22
26
18
32
1.97
110966714--110966787
3
24.7
3
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0
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0
0
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0.92
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3
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10
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65
2
0
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2.5
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84
12
51
66
2
0
30
1.05
110973553--110973697
45
3.2
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24
25
25
24
2.00
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2.0
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285
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16
29
1.92
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55
4.1
54
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7
282
36
17
17
28
1.93
110974134--110974271
71
2.0
70
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1
222
31
22
17
28
1.96
110974132--110974535
173
2.4
170
84
8
526
34
20
18
26
1.96
110977562--110977632
3
24.0
3
97
2
135
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0
0
33
0.92
110978095--110978133
19
2.1
19
100
0
78
69
0
30
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0.89
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19
3.0
20
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70
63
0
36
0
0.94
110978102--110978157
21
2.8
21
86
10
73
60
0
39
0
0.97
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166
2.0
169
90
1
526
32
17
15
34
1.91
110986289--110986405
27
4.4
27
81
2
110
28
29
17
23
1.97
110987383--110987414
2
16.0
2
100
0
64
50
0
0
50
1.00
110988435--110988490
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2.8
21
81
7
55
48
16
3
32
1.63
110992328--110992457
3
42.7
3
70
11
77
31
4
3
60
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
110992375--110992457
39
2.1
39
84
4
105
30
3
4
61
1.34
110992627--110992653
14
1.9
14
100
0
54
37
11
0
51
1.37
110992654--110992776
64
2.0
59
81
10
140
34
6
6
52
1.53
110992719--110992776
23
2.5
23
80
5
64
34
5
5
55
1.45
110992939--110993032
27
3.6
26
80
5
100
31
8
5
54
1.53
110993100--110993142
19
2.3
19
84
8
52
27
2
4
65
1.25
110996860--110996912
27
1.9
28
84
3
72
30
18
5
45
1.73
110996890--110996944
22
2.5
22
88
8
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25
20
3
50
1.64
111004318--111004398
41
2.0
41
85
2
110
53
13
20
12
1.72
111016918--111017871
133
7.1
134
87
1
1297
29
20
22
27
1.99
111017874--111018071
85
2.3
85
92
1
317
30
22
24
21
1.99
111021714--111021843
3
42.7
3
68
11
68
30
4
3
60
1.35
111021752--111021866
12
9.0
12
70
22
67
32
4
3
60
1.33
111021716--111021815
24
4.0
24
76
17
87
28
5
3
64
1.29
111021761--111021843
39
2.1
39
84
4
105
30
3
4
61
1.34
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1.9
14
100
0
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37
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51
1.48
111022101--111022158
23
2.6
23
83
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34
3
5
56
1.38
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25
3.3
23
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17
53
34
7
7
51
1.57
111022232--111022342
21
5.4
21
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32
6
4
56
1.44
111022327--111022420
27
3.6
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30
7
5
56
1.49
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30
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4
62
1.28
111023081--111023118
17
2.2
18
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4
51
39
0
7
52
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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6
0
23
1.12
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0
0
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2.0
25
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0
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5
15
1.24
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0
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4
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111028603--111028691
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0
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1.94
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1.93
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1.8
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0
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3
0
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2
4
76
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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1.9
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1.94
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3.0
30
77
8
83
30
4
3
61
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111122801--111122881
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0
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1.02
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1.9
18
94
5
61
58
5
8
26
1.51

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410