Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   

This is table  324  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100595897--100595961
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4.0
16
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9
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56
1
0
41
1.08
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23
2.1
24
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3
64
18
14
2
65
1.37
100598276--100598379
28
3.7
27
74
13
93
28
28
14
27
1.95
100598270--100598389
56
2.1
57
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4
145
30
27
13
29
1.94
100598301--100598387
28
3.1
28
83
6
113
29
26
13
29
1.94
100598602--100598644
8
5.4
8
78
10
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4
23
18
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2.2
20
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0
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20
11
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2.1
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29
26
11
32
1.92
100606070--100606181
28
4.0
29
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2
122
28
27
12
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1.93
100610092--100610184
7
13.1
7
69
18
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49
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2
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1.61
100610085--100610159
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12
75
50
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16
1.53
100610101--100610172
21
3.4
20
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16
56
50
26
2
20
1.62
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1.9
83
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0
217
36
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15
43
1.66
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36
1.9
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85
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93
25
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1.38
100618699--100618728
15
2.0
15
100
0
60
6
40
13
40
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2.3
24
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3
20
1.17
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25
2.0
25
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68
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9
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1.07
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2.0
46
100
0
184
45
15
17
21
1.85
100629168--100629240
23
3.2
23
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21
62
47
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16
19
1.82
100635864--100635925
23
2.6
23
70
14
54
38
4
1
54
1.31
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130
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0
66
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13.5
2
100
0
54
51
0
0
48
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100653209--100653336
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3.1
42
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2
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29
18
24
27
1.98
100653209--100653325
41
2.8
41
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1
198
29
20
23
26
1.99
100653585--100653610
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3.2
8
100
0
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0
0
1.00
100654903--100654949
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3
100
0
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0
0
65
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26
5.2
26
94
0
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36
25
5
33
1.78
100669684--100669816
26
5.2
26
90
5
209
36
24
5
33
1.78
100669684--100669816
49
2.6
51
94
3
225
36
24
5
33
1.78
100673645--100673777
25
5.2
26
90
5
218
36
24
5
33
1.78
100673645--100673777
51
2.6
50
96
1
239
36
24
5
33
1.78
100679365--100679500
26
5.2
26
94
0
236
36
25
5
33
1.78
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69
2.1
69
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0
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14
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1.93
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30
2.1
30
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16
25
1.90
100691814--100691864
8
6.4
8
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17
52
50
13
21
13
1.76
100691814--100691864
24
2.1
24
92
0
84
50
13
21
13
1.76
100692988--100693108
60
2.0
60
96
0
224
31
9
16
42
1.81
100701809--100701940
12
11.4
11
67
22
58
41
1
3
53
1.28
100710921--100710956
16
2.2
16
95
0
63
22
16
2
58
1.51
100714540--100714585
21
2.2
20
81
7
56
50
2
13
34
1.53
100716025--100716108
7
11.9
7
78
2
60
22
0
29
47
1.52
100716025--100716104
14
5.6
14
77
2
79
23
0
27
48
1.51
100716028--100716104
21
3.6
21
75
3
82
23
0
27
49
1.50
100716028--100716103
22
3.5
22
76
5
66
22
0
27
50
1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100717870--100717918
23
2.1
23
100
0
98
44
12
16
26
1.82
100718138--100718213
27
2.9
27
83
11
86
61
2
3
31
1.28
100718607--100718656
25
2.0
25
84
7
66
64
2
6
28
1.28
100718675--100718708
17
1.9
18
88
5
52
55
8
0
35
1.31
100721669--100721713
21
2.1
22
84
12
58
35
2
0
62
1.08
100721999--100722047
23
2.0
25
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7
66
22
6
4
67
1.30
100724494--100724533
3
13.0
3
84
5
53
32
5
0
62
1.17
100724565--100724624
26
2.3
27
80
13
72
35
0
3
61
1.12
100724579--100724634
26
2.0
26
83
10
67
33
1
1
62
1.16
100724716--100724761
23
2.0
24
83
12
60
28
13
4
54
1.57
100724747--100724799
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2.4
21
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15
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28
11
0
60
1.31
100725941--100726026
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17.2
5
70
25
58
34
4
0
60
1.17
100725942--100726026
26
3.4
26
71
22
74
35
4
0
60
1.18
100725949--100725990
19
2.3
18
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4
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38
2
0
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3
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1.40
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50
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35
6
3
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1.43
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14
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14
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20
51
35
6
1
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1.35
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29
2.9
28
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31
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3
57
1.42
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25
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88
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30
2
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63
1.24
100730494--100730535
8
5.5
8
94
2
61
30
0
4
64
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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16
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0
4
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5
23
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24
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15
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3
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1.42
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25
2.8
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30
1
2
64
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0
0
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0
1
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1.98
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28
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29
22
1.98
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180
19
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29
1.97
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0
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1.98
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2.1
83
100
0
346
25
22
27
24
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100780059--100780112
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18
18
1.81
100780951--100781061
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18
1.81
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1.91
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32
1.93
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1.83
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1.83
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0
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1.34
100844738--100845052
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44
75
10
145
26
19
29
24
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100844733--100844851
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28
26
1.98
100844644--100845052
48
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28
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27
23
1.98
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20
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0
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3
84
8
100
62
0
2
34
1.09

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410