Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  317  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
G
T
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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55
4
4
35
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98666401--98666503
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10
71
25
61
60
2
3
33
1.30
98666377--98666495
35
3.4
35
74
16
104
57
4
5
32
1.39
98666406--98666529
22
5.7
22
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20
118
59
3
3
33
1.29
98666318--98666452
58
2.3
59
82
12
161
54
4
3
37
1.38
98666408--98666530
46
2.8
40
78
18
122
60
3
3
33
1.29
98666662--98666715
24
2.3
24
78
18
60
64
1
9
24
1.32
98666713--98666757
24
2.0
24
86
8
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57
4
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35
1.31
98666720--98666805
28
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98666731--98666770
20
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21
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5
0
37
1.21
98666710--98666805
23
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23
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21
72
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2
36
1.34
98666878--98666948
9
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59
0
2
38
1.12
98666891--98666942
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2.9
18
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0
3
38
1.17
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1.94
98672912--98672989
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10
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18
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60
3
0
35
1.15
98672893--98672950
28
2.0
30
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3
0
32
1.11
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19
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5
0
31
1.18
98674482--98674533
22
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23
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0
53
1.34
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13
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34
13
0
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1.42
98678197--98678249
22
2.5
22
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1.68
98678613--98678650
12
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12
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36
0
0
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0.95
98682132--98682166
15
2.3
15
100
0
70
37
5
34
22
1.78
98684035--98684095
28
2.3
25
77
8
68
65
27
3
3
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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0
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2
0
48
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2.6
37
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4
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1.41
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3.0
12
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0
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27
25
5
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1.77
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69
2.5
70
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2
217
28
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2.0
70
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23
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1.93
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140
3.5
140
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870
25
17
20
37
1.93
98695519--98695552
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13
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1.59
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1.94
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2.0
121
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1.94
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75
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16
18
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1.94
98695834--98696187
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1.94
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18
34
1.94
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13
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30
13
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50
1.65
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1.8
88
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254
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244
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29
17
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2.0
30
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23
2.7
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52
43
0
3
1.18
98697417--98697465
21
2.2
23
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7
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59
36
0
4
1.17
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20
2.0
20
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40
0
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2.0
33
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11
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29
10
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19
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33
1.9
33
84
12
87
31
9
25
34
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98723351--98723391
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1.9
22
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17
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1.50
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0
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0
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1.47
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3.0
70
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10
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98731532--98731640
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23
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2.3
19
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15
15
4
65
1.43

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410