Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   

This is table  399  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
120800734--120800760
7
3.9
7
100
0
54
70
0
0
29
0.88
120801130--120801161
16
2.0
16
100
0
64
56
0
18
25
1.42
120811037--120811075
19
1.9
20
85
15
53
33
46
2
17
1.62
120811137--120811250
27
4.2
26
87
5
147
36
22
23
16
1.94
120811137--120811250
54
2.1
54
88
3
167
36
22
23
16
1.94
120811352--120811428
29
2.8
27
82
7
84
31
11
22
35
1.90
120812872--120812981
26
4.2
26
97
0
184
36
24
5
33
1.79
120816212--120816273
27
2.2
29
80
8
74
20
6
3
69
1.25
120817993--120818040
16
3.1
15
90
6
69
64
2
2
31
1.16
120817989--120818044
24
2.3
24
81
6
69
66
1
1
30
1.12
120817989--120818040
8
6.5
8
82
8
61
65
1
1
30
1.14
120818194--120818242
25
2.0
25
91
0
80
51
6
8
34
1.57
120818281--120818345
25
2.7
23
80
7
67
58
1
3
36
1.23
120818275--120818417
58
2.4
59
76
13
143
56
2
4
36
1.33
120818375--120818420
25
1.9
25
86
8
69
60
0
4
34
1.16
120818916--120819060
30
4.8
31
85
3
174
20
4
47
26
1.70
120823221--120823396
46
3.8
46
78
12
207
21
21
28
28
1.98
120823217--120823388
93
1.8
93
93
0
299
20
22
29
27
1.99
120831467--120831498
11
2.6
13
90
9
50
9
6
9
75
1.20
120835359--120835417
27
2.2
28
85
11
79
32
8
6
52
1.58
120836337--120836397
15
4.1
15
71
10
54
57
1
0
40
1.08
120836332--120836393
30
2.1
30
87
6
90
54
3
0
41
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
120839252--120839393
3
49.3
3
68
20
81
30
4
0
64
1.20
120839266--120839300
17
2.1
17
94
0
61
34
2
0
62
1.10
120839252--120839396
14
10.1
14
70
23
72
30
4
0
64
1.19
120839273--120839396
17
7.5
17
75
14
66
31
3
0
64
1.15
120839286--120839385
38
2.8
36
81
11
107
30
4
1
65
1.18
120839745--120839864
50
2.5
48
78
16
124
33
8
0
57
1.34
120839904--120839934
11
2.7
11
95
5
53
38
0
6
54
1.26
120851881--120852093
88
2.4
88
84
7
274
28
16
21
34
1.95
120852049--120852196
78
1.9
79
85
4
210
28
16
21
33
1.95
120852293--120852327
14
2.5
14
90
0
52
17
14
5
62
1.49
120852126--120852313
102
1.8
103
85
5
265
26
18
18
37
1.93
120852218--120852651
83
5.0
90
74
13
329
26
17
19
36
1.94
120852572--120852822
129
2.0
124
84
8
328
28
15
19
36
1.92
120852696--120852865
74
2.3
74
84
6
209
27
16
17
38
1.91
120852772--120852999
89
2.6
85
81
8
262
27
16
18
37
1.93
120854933--120855014
14
5.9
14
76
20
59
32
3
1
62
1.21
120854919--120855057
3
48.3
3
66
21
66
30
5
0
63
1.23
120854938--120855014
12
6.7
12
78
15
74
33
2
1
62
1.17
120854940--120855039
38
2.6
40
77
16
113
30
4
1
65
1.18
120854940--120855014
26
3.0
23
81
11
71
33
2
1
62
1.17
120854951--120855125
93
1.9
93
80
9
205
30
7
1
61
1.31
120855146--120855181
17
2.2
17
90
5
56
11
5
8
75
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
120855495--120855659
22
7.1
22
68
22
72
35
5
4
54
1.43
120855561--120855616
2
28.5
2
81
3
69
41
0
5
53
1.24
120855643--120855695
25
2.2
24
83
12
65
39
15
3
41
1.65
120856919--120856979
22
2.8
22
80
2
61
68
6
6
18
1.33
120857070--120857095
3
8.7
3
100
0
52
65
0
0
34
0.93
120857571--120857626
25
2.2
25
87
3
76
50
21
3
25
1.65
120857821--120857855
12
2.9
12
87
12
54
5
2
8
82
0.91
120857822--120857853
11
2.8
11
95
4
55
6
3
6
84
0.86
120858221--120858791
205
2.8
205
92
1
896
30
22
18
29
1.97
120866974--120867023
15
3.5
14
79
15
50
42
8
24
26
1.82
120868812--120868946
25
5.2
24
77
19
137
33
5
22
38
1.77
120868876--120868936
32
1.9
32
90
6
97
36
4
19
39
1.74
120875857--120876016
26
6.2
26
86
1
223
33
6
23
36
1.80
120875857--120876016
52
3.1
52
91
0
257
33
6
23
36
1.80
120888053--120888104
15
3.4
15
72
2
50
50
3
7
38
1.50
120888126--120888156
2
15.5
2
93
0
53
48
0
3
48
1.17
120888674--120888761
36
2.4
36
98
0
167
26
23
23
26
2.00
120891868--120892100
73
3.2
72
82
6
270
30
17
18
32
1.95
120892080--120892113
14
2.4
14
95
0
59
14
23
5
55
1.61
120892024--120892243
90
2.4
89
84
4
264
28
17
18
35
1.94
120894312--120894366
16
3.4
16
87
7
67
30
5
7
56
1.49
120894594--120894649
22
2.6
22
75
13
62
33
3
7
55
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
120895045--120895372
43
7.6
42
76
6
273
32
23
19
24
1.98
120895051--120895369
87
3.7
87
86
3
326
32
23
19
24
1.97
120896251--120896288
19
2.1
18
85
9
51
52
0
7
39
1.31
120898348--120898399
3
17.3
3
95
0
95
34
1
0
63
1.06
120903525--120903561
19
1.9
19
88
0
56
13
13
8
64
1.48
120904936--120904974
13
3.0
13
82
14
53
82
2
7
7
0.94
120906056--120906243
66
2.8
66
83
4
254
31
17
12
38
1.87
120906430--120906529
45
2.2
45
79
10
116
24
18
26
32
1.97
120906503--120906897
177
2.2
175
83
5
485
30
16
24
27
1.97
120906686--120907175
265
1.8
266
81
5
616
30
17
23
28
1.97
120906963--120907283
176
1.8
177
88
0
491
29
17
23
28
1.97
120907492--120908003
180
2.9
179
90
1
769
31
16
23
28
1.96
120909129--120909210
26
3.2
26
96
0
146
31
6
25
36
1.81
120915877--120915905
14
2.1
14
93
6
51
31
0
0
68
0.89
120916382--120916468
44
2.0
44
81
4
104
31
16
25
27
1.96
120918436--120918606
87
2.0
87
82
6
213
35
14
19
30
1.92
120920065--120920141
37
2.1
37
95
0
136
42
15
7
33
1.76
120922875--120922950
34
2.1
34
81
13
91
30
3
7
57
1.45
120922965--120923009
21
2.1
21
84
8
56
33
2
4
60
1.29
120922973--120923015
21
2.1
21
86
4
61
37
4
2
55
1.33
120922973--120923028
21
2.8
20
81
7
60
35
7
1
55
1.38
120923092--120923133
21
2.0
21
85
0
57
38
9
7
45
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
120935407--120935845
87
5.0
87
81
5
494
27
17
19
35
1.94
120935724--120935757
14
2.4
14
95
0
59
17
17
5
58
1.57
120935737--120936207
103
4.9
102
76
14
480
25
17
17
39
1.91
120935855--120936260
86
4.5
87
77
14
401
26
17
18
37
1.92
120935650--120936207
189
2.9
190
89
4
824
26
17
17
38
1.92
120936106--120936136
13
2.4
13
94
0
53
12
9
6
70
1.31
120936018--120936430
88
4.7
87
75
10
378
27
16
16
39
1.90
120938636--120938691
21
2.8
20
81
7
60
35
7
1
55
1.38
120938756--120938798
21
2.0
21
86
0
59
37
9
6
46
1.63
120939725--120939832
26
4.2
26
97
0
207
30
6
26
36
1.82
120946756--120946860
26
4.2
25
95
4
185
31
6
25
36
1.82
120946756--120946860
49
2.1
52
94
5
189
31
6
25
36
1.82
120954005--120954088
26
3.2
26
94
0
141
36
26
4
32
1.77
120955283--120955417
68
2.0
68
94
2
236
30
27
5
37
1.79
120955754--120955966
106
2.0
106
86
3
295
37
15
18
29
1.91
120964758--120964799
22
1.9
22
85
9
59
23
52
9
14
1.71
120964845--120964919
23
3.4
21
77
14
71
9
2
33
54
1.46
120964870--120964974
24
4.4
23
72
15
79
11
1
28
58
1.44
120964863--120964968
23
4.4
24
74
9
90
10
0
28
60
1.36
120964902--120964944
22
2.0
21
95
4
77
4
0
25
69
1.07
120965279--120965356
3
25.3
3
71
17
54
29
5
1
64
1.23
120965279--120965361
12
6.7
13
74
15
61
30
6
1
62
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
120965591--120965633
12
3.5
12
83
3
50
37
0
4
58
1.19
120965739--120965787
24
2.0
24
92
7
82
32
0
8
59
1.27
120968271--120968304
6
5.8
6
93
6
61
17
17
17
47
1.84
120971090--120971165
6
13.0
6
81
13
63
88
9
0
2
0.62
120971091--120971152
1
62.0
1
83
0
79
91
4
0
3
0.48
120972854--120972980
66
1.9
66
93
0
218
32
18
12
36
1.89
120973044--120973810
44
17.7
43
74
9
454
35
21
22
20
1.96
120973045--120973547
87
5.8
86
75
10
280
35
21
23
19
1.96
120973038--120973547
216
2.4
215
88
4
733
35
21
22
19
1.96
120973169--120973723
132
4.2
132
85
5
788
35
21
22
20
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410