Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  373  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
114080404--114080446
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2.0
22
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0
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127
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1
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137
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0
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23
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114093632--114093746
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2.1
54
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23
16
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10
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5.4
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87
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20
23
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1.97
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7.6
44
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205
34
21
23
20
1.97
114110751--114110788
17
2.2
17
86
9
51
21
52
13
13
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3
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3
3
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1.24
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15
2.9
15
86
6
52
27
6
0
65
1.18
114112054--114112115
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1.9
32
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15
83
29
8
0
62
1.23
114112086--114112131
21
2.1
22
88
11
69
28
8
0
63
1.24
114114361--114114506
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70
17
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2
59
1.38
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0
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0
0
50
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36
1.65
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22
3.3
22
75
10
69
60
5
5
29
1.41
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25
2.5
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7
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58
6
4
30
1.43
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5.0
25
72
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5
36
1.41
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16
2.4
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43
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4.0
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20
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48
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1.73
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2.6
87
80
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248
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15
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1.93
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63
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1.48
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90
3.0
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82
8
318
36
19
17
26
1.94
114117485--114117720
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2.7
88
83
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291
37
19
16
26
1.93
114117628--114118580
75
13.1
74
86
8
1314
33
20
16
30
1.94
114117634--114118655
146
7.0
147
88
5
1350
33
20
16
30
1.94
114117649--114118655
364
2.7
364
93
4
1677
32
20
16
30
1.94
114118500--114118655
83
1.9
84
94
1
278
34
20
16
28
1.94
114118578--114118888
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3.1
98
90
3
446
41
18
17
23
1.90
114118758--114118801
14
3.4
13
84
9
63
70
6
9
13
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
114118770--114118944
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87
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17
24
1.94
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12
2.8
12
86
4
50
0
15
0
84
0.61
114119807--114119839
17
1.9
17
88
11
50
0
15
0
84
0.61
114130857--114130911
25
2.3
23
78
12
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43
3
16
36
1.65
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19
2.8
19
81
8
58
60
5
5
28
1.41
114131017--114131092
29
2.6
29
81
4
82
59
3
6
30
1.41
114130967--114131070
44
2.4
43
80
7
111
60
3
5
29
1.38
114131047--114131111
14
4.6
14
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55
56
1
4
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1.29
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5.6
25
74
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100
56
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5
35
1.38
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2.4
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121
53
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5
36
1.42
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1.75
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19
32
1.95
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22
2.8
22
82
0
77
26
50
8
14
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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2.3
27
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1.37
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1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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6
0
40
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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6
63
31
2
2
64
1.18

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410