Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13 124041150 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124041150

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  34  of  410  ( 49152 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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11
0
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2.2
26
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5
23
1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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2.0
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2
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1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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14
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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29
11
22
36
1.89
8584717--8584756
20
2.0
20
100
0
80
35
10
15
40
1.80
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21
2.0
21
90
0
64
29
21
29
19
1.98
8595366--8595422
3
18.7
3
92
3
96
66
1
1
29
1.12
8595636--8595733
31
3.2
30
74
8
92
41
10
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38
1.71
8604938--8604987
20
2.6
18
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15
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18
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4
74
1.14
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13
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13
100
0
54
14
14
0
70
1.17
8607094--8607164
5
13.2
6
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14
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33
2
14
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1.58
8607086--8607141
27
2.1
27
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0
103
30
7
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1.59
8607123--8607168
20
2.2
21
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7
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32
0
19
47
1.50
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17
11
1.62
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21
2.5
20
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53
1
0
44
1.11
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26
2.2
26
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3
25
1.20
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2.3
28
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27
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14
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1.65
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2
20.5
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0
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0
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19
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0
0
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1.00
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4.0
22
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1.74
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20
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15
1.9
15
100
0
58
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17
13
27
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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0
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0
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14
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3.2
25
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0
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0
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0
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23
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2.0
30
96
0
109
33
22
13
30
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8689385--8689421
18
2.1
18
100
0
74
27
18
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2.5
20
89
0
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4
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30
1.52
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20
2.0
20
100
0
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1.54
8705514--8705554
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2.0
21
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0
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2.5
27
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1
0
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1
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0
0
58
0.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410